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無標記定量技術(LFQ):原理、應用與最新進展檢測技術服務詳情介紹
引言:為何越來越多科研人員選擇LFQ?
在蛋白組學研究中,“定量”不僅是對蛋白存在與否的判斷,更是對其在不同生理或病理狀態下表達變化的jīngzhǔn刻畫。傳統的同位素標記方法如TMT、iTRAQ雖然靈敏度高,但成本較高、流程復雜。無標記定量技術(Label-Free Quantification, LFQ)以其樣品處理簡便、適合大規模分析、可自由組合樣本等優勢,逐漸成為dànbáizhì組定量研究的主流。
一、LFQ的基本原理:利用質譜信號強度或譜圖數量定量
LFQ依賴高分辨率質譜(如Orbitrap)對樣品進行數據采集,無需化學或代謝標記,即可通過以下兩種策略進行蛋白定量:
1、MS1信號強度(Intensity-Based Quantification)
每個肽段在一級質譜(MS1)中具有特定的峰面積或離子強度,可以反映其相對豐度。
2、譜圖計數法(Spectral Counting)
通過統計肽段在MS2中被識別的次數(PSM數量)作為豐度的替代指標,適用于高豐度蛋白的定量比較。
百泰派克生物科技基于MaxQuant + Perseus等主流平臺,整合信號強度與譜圖計數兩類策略,為客戶提供高重復性、低噪聲的無標記定量技術LFQ數據。
二、LFQ的技術流程全解析
為了獲得可靠的定量結果,LFQ通常包括以下關鍵步驟:
1、樣本制備
(1)統一蛋白濃度
(2)yídànbáiméi酶解成多肽
(3)反應終止后純化上機
2、LC-MS/MS分析
(1)采用高分辨率液相色譜-串聯質譜平臺(如Q Exactive系列)
(2)保證每個樣品獨立上機,避免交叉污染
3、數據處理
(1)使用MaxQuant或Proteome Discoverer等軟件提取肽段強度
(2)去除缺失值、標準化處理
(3)統計顯著差異蛋白
三、無標記定量技術的優勢與局限
1、優勢
2、局限
(1)樣本間批次差異較大時,可能出現技術偏倚
(2)對質譜設備穩定性和操作一致性要求高
(3)缺失值處理對統計學方法依賴性強
百泰派克在LFQ服務中設置質控樣 + 仿真調控樣本,顯著提升跨批次穩定性與差異蛋白檢出率。
四、LFQ的經典應用場景
1、疾病機制研究
LFQ可揭示疾病組織與正常組織在dànbáizhì表達層面的差異,輔助構建調控通路網絡。
2、藥物作用機制探索
通過比較藥物處理前后蛋白組變化,評估靶點表達及下游信號影響。
3、環境應激與毒理響應分析
用于研究細胞或微生物在高溫、重金屬、氧化應激等條件下的蛋白響應模式。
4、外泌體蛋白組定量
結合高靈敏度質譜,LFQ成為外泌體功能蛋白譜構建的重要工具。
五、zuì新進展:LFQ正在邁向更高精度與更強適應性
1、DIA(Data-Independent Acquisition)+ LFQ
通過全掃描方式獲取MS/MS數據,結合Spectronaut、DIA-NN等算法,實現更高數據完整性和定量一致性。
2、AI算法優化定量流程
基于機器學習的缺失值補全、差異蛋白篩選、功能預測技術正在加速LFQ數據從“結果”到“發現”的轉化。
3、多組學聯合分析趨勢
LFQ蛋白組數據正越來越多與轉錄組、代謝組、磷酸化組等多組學數據融合使用,提升機制解析的系統性。
百泰派克生物科技:一站式無標記定量蛋白服務平臺
作為生命科學CRO服務提供商,百泰派克生物科技深耕蛋白組學領域十余年,構建了完善的LFQ服務體系,服務特色:
高通量Orbitrap平臺,適配LFQ/DIA全策略
提供蛋白提取、質譜上機、數據分析一體化方案
融合生物通路富集、PPI分析、GO/KEGG注釋等zhuānyè生信服務 可配套多組學聯合方案(如LFQ+轉錄組),推動科研從“變化”走向“機制”
無標記定量技術作為一種兼具成本效率與研究深度的策略,已成為現代dànbáizhì組學中bùkěhuòquē的工具。未來,隨著儀器性能、算法水平與數據庫質量的持續提升,LFQ將邁入更智能、更系統、更jīngzhǔn的時代。如果您正在開展蛋白表達、疾病機制、藥物篩選等相關研究,歡迎聯系我們獲取LFQ個性化服務方案!百泰派克生物科技助您高效獲取可靠數據,推動成果落地!
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!