利用化學蛋白質組學揭示蛋白-配體相互作用檢測技術服務詳情介紹

在細胞內，幾乎所有的生物過程都離不開dànbáizhì與配體的相互作用（protein-ligand interactions）。這些配體可以是小分子藥物、代謝物、脂類、甚至金屬離子。深入理解這些相互作用不僅有助于揭示信號通路、調控機制和疾病機制，更是藥物發現、靶點驗證以及機制研究的關鍵一步。然而，蛋白-配體相互作用具有動態性強、特異性高、背景復雜等特點，傳統的親和層析、生化驗證手段難以實現高通量、全譜級的篩查和定量。在這一背景下，化學dànbáizhì組學（Chemical Proteomics）作為一項融合了有機化學、dànbáizhì組學和質譜分析的交叉學科技術，正日益成為研究蛋白-配體互作的新利器。

一、什么是化學dànbáizhì組學？

化學dànbáizhì組學是一種基于小分子探針和高分辨質譜的靶標識別策略，能夠在細胞或組織背景下篩選與特定配體結合的dànbáizhì群體。

其核心流程包括：

• 設計并合成帶有標簽的配體衍生物（通常是活性探針，如共價探針、光交聯探針）

• 與活細胞或裂解物孵育，使探針與靶蛋白發生特異性結合

• 富集結合蛋白（如利用shēngwùsù-鏈霉親和素系統）

• 經酶解后用LC-MS/MS鑒定結合蛋白，并進行定量比較

這一技術的zuì大優勢在于可以在復雜生理背景中原位捕捉配體結合蛋白，不僅保留天然構象和微環境，也避免了純化過程中相互作用的丟失。

二、化學dànbáizhì組學的核心策略與技術類型

1、活性位點標記（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）

通過設計能夠共價修飾蛋白活性位點的探針，ABPP可jīngzhǔn捕捉功能性dànbáizhì，尤其適用于水解酶、氧化還原酶等。

• 常用的探針結構：親核反應團 + 報告標簽 + 骨架

• 可與定量質譜（如SILAC、TMT）聯用，實現高通量篩選

2、光交聯探針（Photoaffinity Labeling）

光交聯探針通過紫外光照射產生短壽命的高活性中間體，與靶蛋白形成不可逆的共價鍵，適合研究瞬時性、弱相互作用。

• 常用光交聯基團：芳基氮烯（Ar-N3）、苯重氮鹽等

• 與同位素標記或label-free方法結合，提升定量能力

3、競爭結合實驗（Competitive Binding）

將帶標簽的探針與非標記配體進行競爭實驗，可用于驗證配體特異性，識別真正靶點vs非特異結合蛋白。

三、典型應用場景

1、藥物靶點識別與驗證

在新藥研發過程中，快速準確地識別候選化合物的作用靶點是機制研究與結構優化的基礎。化學dànbáizhì組學可在細胞內原位捕捉與小分子藥物結合的dànbáizhì群體，為靶點驗證與脫靶分析提供高通量解決方案。

2、天然產物機制解析

天然產物具有高度結構多樣性，其作用機制往往難以預測。通過結合共價或光交聯探針，化學dànbáizhì組學能夠幫助研究人員全面揭示天然產物與dànbáizhì的互作譜，挖掘潛在治療靶標。

3、表型篩選后的靶點反推

高內涵篩選等表型導向策略常能篩選出功能活性分子，但具體靶點不明確。化學dànbáizhì組學可用于反推這些分子的蛋白結合靶點，加快從“表型到機制”的轉化效率。

4、毒理學與環境暴露研究

某些藥物代謝產物、環境毒素或內源代謝物可能通過與dànbáizhì的結合引發毒性反應。利用化學dànbáizhì組學可系統性評估這些分子與蛋白互作帶來的功能擾動，揭示毒性機制。

四、技術優勢與挑戰并存

1、優勢

• 高通量：一次實驗可識別上百個潛在靶標

• 原位性強：保持天然相互作用背景

• 特異性好：結合探針結構優化提高識別能力

• 易于定量：可結合多種質譜定量策略

2、挑戰

• 探針設計要求高：需兼顧親和力、反應活性與細胞通透性

• 背景噪音干擾：需合理設置對照組與統計閾值

• 數據解讀復雜：需整合dànbáizhì功能注釋、通路分析等生信手段

化學dànbáizhì組學的興起，為破解蛋白-配體相互作用提供了全新視角。其兼具高通量、原位性和特異性的特質，已成為現代藥物研發與機制探索bùkěhuòquē的關鍵工具。百泰派克生物科技化學dànbáizhì組學全面解決方案包括從實驗設計、樣品制備、探針合成、靶標鑒定以及數據分析的全流程，為您提供一站式的無憂服務，滿足您在藥物開發和藥物發現領域生物標志物研究、藥物和靶點發現、通路建模、藥物作用研究等的多種需求。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

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