使用De Novo技術進行高精度抗體測序檢測技術服務詳情介紹

引言：為什么抗體測序越來越重要？

抗體，作為適應性免疫系統的核心執行者，其多樣性和特異性使其在基礎研究、診斷開發、生物制藥等多個領域都發揮著舉足輕重的作用。從單克隆抗體的開發，到新型疫苗的評估，再到腫瘤miǎnyìzhìliáo的機制解析，獲取抗體的全序列信息成為關鍵dìyī步。

然而，傳統的抗體測序方法往往依賴已知數據庫或抗體來源細胞的mRNA信息，限制了對天然抗體、多克隆抗體、或者臨床樣本中稀有抗體的全面解析。在此背景下，基于質譜的De Novo抗體測序技術應運而生，正在逐步成為抗體研發和表征的重要手段。

一、什么是De Novo抗體測序？

De Novo測序是指在缺乏已知數據庫參考的情況下，直接通過質譜數據推斷dànbáizhì序列的過程。相較于依賴數據庫比對的傳統質譜分析方法，De Novo測序不受數據庫覆蓋率限制，能夠實現真正意義上的全序列解析，尤其適用于未知抗體或來源復雜的樣本。

抗體De Novo測序的一般流程包括：

1、樣本制備：將抗體進行酶解，常用酶包括Trypsin、Chymotrypsin、LysC等；

2、質譜分析：采用高分辨率質譜（如Orbitrap、TOF）采集多肽片段的MS/MS信息；

3、序列推斷：使用專用的De Novo算法（如PEAKS、Novor）解析肽段序列；

4、序列拼接與重建：結合抗體結構特征，拼接出完整的輕鏈與重鏈序列；

5、功能驗證：通過重組表達與ELISA、SPR等手段驗證序列的功能正確性。

二、為什么選擇De Novo技術進行抗體測序？

1、不依賴mRNA信息，更適用于臨床樣本和天然抗體

在許多實際場景中，例如來自血清、組織液等臨床樣本中的抗體，僅依賴B細胞mRNA進行序列分析往往面臨細胞獲取困難、表達量低等問題。而De Novo測序則直接以蛋白為對象，無需依賴核酸信息，在天然抗體研究中具有顯著優勢。

2、高分辨率質譜賦能，提升測序精度與覆蓋度

隨著質譜儀性能的持續提升，現代儀器已能實現亞ppm級的質量精度和高靈敏度。結合多酶酶解策略與重疊肽段優化算法，De Novo測序的準確率和覆蓋率已接近95%以上，足以滿足抗體工程的應用需求。

3、可揭示抗體異構形式（如糖基化、突變、剪切）

抗體不僅在氨基酸水平存在多樣性，其翻譯后修飾（PTMs）如糖基化、氧化、脫酰胺等也對功能產生重要影響。傳統的基因測序方法無法捕捉這些修飾信息，而質譜則能夠提供修飾位點和修飾類型的直接證據。

三、De Novo抗體測序的技術挑戰與應對策略

1、CDR區域解析難度大

抗體的互補決定區（CDR）富含高變異序列，是抗原結合活性的核心。CDR區域常伴隨序列復雜性高、酶解效率低等問題，影響其在質譜中的檢測頻率。百泰派克生物科技通過多酶聯用、異構體聚焦分析等策略，有效提升CDR區的覆蓋率和序列可信度。

2、同源抗體混合樣本的拆分難度高

當樣本中存在多個同源抗體時（如多克隆抗體或治療前后患者抗體對比），傳統算法難以區分近似序列。百泰派克利用深度覆蓋+智能算法+人工審閱相結合的方式，實現高復雜度背景下的抗體重建。

四、應用場景：De Novo抗體測序的廣泛價值

百泰派克生物科技：高精度De Novo抗體測序服務提供商

在百泰派克，我們結合優良的Orbitrap Fusion Lumos系統與優化的多酶酶解策略，搭配自主開發的序列拼接和修飾分析算法，提供包括：

* 全長抗體序列解析（重鏈+輕鏈）

• CDR區域精細覆蓋驗證

• 抗體修飾圖譜（糖基化、氧化等）

• 同源抗體混合樣本解析服務

我們的技術團隊具備豐富的質譜數據分析經驗，并通過每一例項目進行人工校驗和結構建模驗證，確保結果的可重組性和功能有效性。隨著抗體藥物開發和jīngzhǔn醫學的快速發展，獲取高質量的抗體序列信息已成為基礎性需求。De Novo抗體測序技術正以其高自由度、高準確率、適用性強的優勢，成為科研和產業界bùkěhuòquē的工具。百泰派克生物科技將持續以zhuānyè的技術平臺與服務能力，助力科研人員深度挖掘抗體的結構與功能潛能。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優勢：

1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優勢：

1.技術優良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；

3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!

使用De Novo技術進行高精度抗體測序檢測技術服務詳情介紹