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深圳市安培生物科技有限公司
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盤點RACE技術的幾種類型及特點2021/09/16
在分子生物學中,未知基因全長序列的獲取是研究新基因的重要步驟。當我們不清楚目的基因的完整序列時,獲得未知序列的方法有反向PCR、mRNA差異顯示技術、基因組減法技術以及cDNA文庫篩選技術等等......背景介紹今天我們來一起了解一種可從低豐度轉錄本中獲得cDNA末端序列的方法—RACE技術。當我們不清楚目的基因的完整序列,只知道其中的一段序列時,就可以通過RACE技術獲得mRNA兩端序列,再與已知序列拼接,從而得到完整mRNA序列。相比其他獲得mRNA全長的技術,RACE具有簡單、快速、廉價的
搞定內參,駕馭 Western blot 已成功一半2021/09/15
westernblot對絕大多數實驗新人而言,絕對是心中痛,一碰就要抓狂。沒辦法,誰讓導師發話了,WB做不好,延畢就是分分鐘的事兒。這還真是讓小伙伴們感嘆道,WB想說愛你不容易。那么為了*馴服WB,獲得漂亮且理想的實驗結果,一個良好的參照體系就絕對是*的存在。一般而言,良好的參照體系包括:*體重計(分子量marker):可確定蛋白條帶對應的分子量大小*光桿司令(空白對照):不加一抗和二抗,用于檢測膜的性質的封閉效果*好榜樣(陽性對照):已知量標準產物的正對照,可檢測抗體的工作效率*打醬油的(陰性
用磷酸化抗體做Western Blot時,要注意哪些?2021/09/15
今天給大家分享一下在用磷酸化抗體做WesternBlot時,應該注意些什么。1.警惕內部敵人一定要在lysisbuffer中加入蛋白酶抑制劑,還要加入一定量的磷酸酶抑制劑,因為組織或細胞裂解時會釋放出大量磷酸化蛋白的死對頭——內源性蛋白磷酸酶,催化磷酸化蛋白(R-p)的去磷酸化,導致不同于正常生理狀態的差異。因此,外源性加入蛋白磷酸酶抑制劑,抑制磷酸化蛋白的去磷酸化,維護蛋白質的磷酸化狀態,否則即使band壓出來也會很淺,結果也不可信。2.低溫能讓他們緊緊地擁抱對方加一抗后最好4度過夜,低溫能讓
Western blot實驗結果分析2021/09/15
Westernblot實驗結果分析①微笑條帶解析:由于凝膠的中間部分凝固不均勻所致,多出現于較厚的凝膠處理辦法:配膠時一定要充分混勻,待其充分凝固后再做后續試驗②帶出現紋理現象解析:樣品不溶性顆粒處理辦法:加樣前最好是離心一下樣品③電泳條帶粗(這是個內參β-actin)解析:蛋白樣品沒有濃縮,量太大④條帶出現好多洞洞解析:轉膜的時候沒有把三明治里的氣泡干掉WesternBlot是生物學上一種非常常用的實驗方法,與之相似的還有SouthernBlot和NorthernBlot。但WB失敗的情況也很
WB的免疫印跡操作分享2021/09/14
①膜處理(甲醇1min,風干(放濾紙上),甲醇1min,水1min)②封閉(用TBST配5%牛奶)1h配搖床③加一抗,牛奶稀釋,所需濃度參考抗體說明書,看膜的大小配多少一抗,4°過夜。④室溫孵育20min⑤0.1%TBST洗10minx3次配搖床(0.1%TBST:tris12.1g,NaCl87.66g,HCl至PH7.6后定容至1L后,加入1ml的TWEEN20)⑥加二抗,牛奶稀釋,一般1:10000,1h配搖床⑦0.1%TBST洗10minx3次配搖床⑧發光(A液B液等體積混合,孵膜1mi
WB過程中最重要的環節——轉膜2021/09/14
①跑到溴酚藍距離最下緣25px時配電轉液(tris3.03g,甘氨酸14.4g,甲醇100ml,定容至1L)②在電轉液中剝膠,裁膠,剪膜,膜活化(甲醇1min,去離子水1min,電解液15min)③“三明治”黑板~海綿~三層濾紙~膠~膜(正面朝下,分清左右,與膠對應)~3層濾紙~海綿~白板,夾緊后放入電轉槽中。(海綿,濾紙,膜需浸潤透,過程中不能干,趕趕氣泡)④連接電源,一定要注意紅對紅,黑對黑,定電流和時間(150mA,1h,若分子量大于90,再加200mA,2h)具體情況具體分析經驗總結:溴
WB電泳技巧分享2021/09/14
①清洗玻璃板,去離子水沖,風干或烤干(一定要以處女座的精神去嚴格要求自己把板子洗干凈,相當重要)②按說明書配膠。先配下膠(分離膠),一般兩塊板配10ml的10%的膠(20~80kDa通用)膠的濃度根據你所需要跑的蛋白的分子量大小決定,混勻后灌膠,立即用正丁醇或無水乙醇封,待凝固后倒出正丁醇,用去離子水沖洗,濾紙吸干;③配上膠(積層膠),參考說明書,一般兩塊板配4ml的5%的膠,混勻后灌膠,插板,待凝固。(可4°過夜)④配電泳液(tris3.03g,甘氨酸14.4g,SDS1g,定容至1L)⑤將玻
蛋白樣品的制備與定量2021/09/14
(1)提細胞蛋白①消化或刮下細胞至1.5的EP管中,標記,10000r離心2min,PBS洗3遍②吸去EP管中PBS,最好用濾紙吸干里面的水分,加適量RIPA裂解液(RIPA裂解液:蛋白酶抑制劑=250:1),如果你想做信號通路指標還得再加上磷酸酶抑制劑(磷酸酶抑制劑:RIPA裂解液=1:1000)③冰上裂解30min~1h,開4°離心機④4°離心11000r,20min⑤測蛋白濃度,取上清,加蛋白上清的四分之一體積5x上樣loadingbuffer,煮沸,分裝(蛋白質變性)(2)提組織蛋白①研
三天征服Chip的經驗分享2021/09/13
在科研界,CHIP無疑是高冷的女神,在追逐的過程總是分分鐘虐得體無完膚,糟心的實驗結果更是分分鐘想去“狗帶”。征服CHIP的路上,有多虐心就有多少要注意的地方。慶幸的是,曾得到女神青睞的前輩們積累了不少經驗。好的經驗要分享,特地總結了各位高手們做CHIP的經驗,在此奉上,希望能助大家一臂之力。染色質免疫共沉淀(chromatinimmunoprecipitation,CHIP)是目前研究體內DNA與蛋白質相互作用的*方法,能夠比較真實的反應細胞內轉錄因子TF與啟動子Promoter的結合情況。其
CO-IP沒有條帶的常見原因和解決的辦法2021/09/13
CO-IP并不容易做,尤其是兩個蛋白豐度低,相互作用力較弱的時候。做CO-IP經常會遇到沒有條帶的問題。這里談談CO-IP沒有條帶的常見原因和解決的辦法,更有獨門配方獻上。蛋白濃度過稀絕大多數情況下,CO-IP沒有條帶是由于蛋白濃度過稀。裂解產物的蛋白濃度越高越好。但是,有些實驗室喜歡稀釋裂解樣品的蛋白濃度再做CO-IP。其實,在大多數情況下要盡可能避免稀釋你的細胞裂解液。盡量使細胞裂解產物的蛋白濃度可達7-8mg/ml左右。這才會避免發生沒有條帶的情況。沒有裂解開很多時候,由于裂解液不夠強烈,
染色質免疫共沉淀值得注意的15個細節2021/09/13
染色質免疫共沉淀,又叫Chip(ChromatinImmunoprecipitation)。Chip又正好是英語里面薯片的意思。為了有趣,就叫薯片實驗吧。做薯片做了幾個月,時間不長,但深刻體會到了魔鬼都在細節中和細節決定成敗。現在把值得注意的15個細節總結如下:1、cellcounting:盡量做到準確準確再準確,否則會影響input結果。2、crosslink:甲醛的終濃度是1%,這個基本所有的protocol上都會強調。3、resuspendcellswithSDS:一定要選用小的tip頭,
分享染色質免疫共沉淀的方法2021/09/13
目前,不斷發展的DNA和蛋白質相互作用的方法和技術已經成為研究DNA復制、重組、修復和轉錄的核心。今天跟大家分享的是花樣百出、拽酷炫的染色質免疫共沉淀的方法!染色質免疫共沉淀(chromatinimmunoprecipitation,CHIP)原理值得注意的是,它是目前*個研究體內DNA與蛋白質相互作用的方法。在生理狀態下,把細胞內的DNA與蛋白質交聯在一起,通過超聲或酶處理將染色質切為小片段后,利用抗原抗體的特異性識別反應,將與目的蛋白相結合的DNA片段沉淀下來,以富集存在組蛋白修飾或者轉錄調
ELISA實驗操作中值得關注的細節大盤點2021/09/10
酶聯免疫吸附測定(ELISA)因其具有敏感性高、特異性強等優點,被廣泛應用于臨床檢測中的各種抗原和抗體的測定。盡管ELISA操作簡單,但是小實驗里也蘊含著大文章,ELISA操作各個環節對實驗的檢測效果影響較大,稍不注意就會產生假陽性或假陰性的結果。現在就跟大家818應用ELISA應該了解的一些常識。ELISA分類及具體過程一般,ELISA可分為以下四大類:直接ELISA、間接ELISA、夾心ELISA、競爭抑制ELISA。其他的ELISA都隸屬于這四類ELISA或由這四類ELISA組合衍生。下面
ELISA實驗中常遇到的問題、產生的原因與解決辦法2021/09/10
酶聯免疫吸附實驗,簡稱為ELISA。ELISA實驗是一種非常經典的免疫學實驗。雖然歷史非常悠久了,但是還是不斷地在臨床和基礎研究中得到應用。其主要用于:免疫酶染色各種細胞內成份的定位;研究抗酶抗體的合成;顯現微量的免疫沉淀反應;定量檢測體液中抗原或者抗體成份。小編總結了一些經驗教訓。遇到的問題,可能的原因,解決方法。供大家參考。問題1:陽性與陰性不能達到2.1的比值,陰性顏色太深。可能的原因:陰性對照(也就是陽性對照的除目標抗原外的其它成分)中有某種成分與一抗作用。解決的方法:純化抗原除去干擾成
一句話知曉實驗方法怎么選?2021/09/08
在分子生物學實驗室里的玩法,無非就是用某種特定的刺激物(如細胞活素)去刺激一些細胞或組織,讓它們high起來,然后分析細胞對這些外源刺激物的反應,檢測細胞內哪條信號通路被激活或失活,或者什么蛋白被分泌出來。這里面就有很多種方法,哪種最合適,關鍵看你要檢測這個反應的哪個方面的特性。WB建立蛋白質的個人檔案一個典型的免疫印跡實驗(WesternBlot,WB)可檢測信號通路中某種蛋白質的特性、表達和分布,分析容量大、敏感度高、特異性強。但至于蛋白-蛋白相互作用則要用另一種更復雜的方法,即免疫共沉淀法
免疫組化(IHC)的10大實戰經驗(附臨床上常用免疫組化指標)2021/09/08
1.把要做的切片先分好,做幾個抗體可分幾盒,不正常組織與正常組織要分開。其余做預實驗用。2.選擇實驗要做的抗體時,要結合他們的正常組織和癌組織的分別表達率。3.試劑盒的選擇可結合生物素強弱的情況。如:肝組織生物素含量高,S-P試劑盒生物素含量也高,故不能配合使用。4.每次開始做時,都必須先清點實驗的必需品是否齊全。想好可能發生的意外,并先想好補救措施。當抗體不夠用的情況下,原先買的抗體最好不要用完,留做可能需要的驗證試驗。新的抗體要盡量同公司,同批號。5.烤片(單一或綜合)程度要適情況而定,可中
免疫組化之8大疑難解答2021/09/08
IHC常見的8大疑問Q1:冰凍切片和石蠟切片如何取材?Answer:冰凍切片取材可分為兩種情況:1)動物灌流固定:如小鼠心臟灌流,首先采用預冷的1×PBS灌流沖洗直至血液全部放出,隨后灌注4%PFA直至小鼠僵直,而后解剖獲取組織,于4℃、4%PFA中固定1h左右,1×PBS洗5次(30min/次),25%蔗糖溶液脫水12h左右包埋即可。2)直接取材:直接選擇新鮮組織進行冰凍切片,此時不需要進行抗原修復。缺點:切出的片子含水量會比較多,形成冰晶影響結果,而且后期的丙酮固定也會改變細胞的形態。石蠟切
免疫組化結果分析應該注意的一些事項和技巧2021/09/08
很多時候,我們千辛萬苦地染出了一張張漂亮的免疫組化片子。但是卻不知道如何正確地分析,得出理想的結果。這實在是一件憾事。其實,免疫組化結果分析的protocol教科書和實驗手冊上面都有。今天主要談談應該注意的一些事項和技巧,并且有獨門絕招獻上,都是干貨喲。對照染色和做實驗的時候必須設立對照組一樣,免疫組化也必須設立對照染色。沒有對照染色的免疫組化結果是不可信的。對照一般有陽性組織對照,陰性組織對照,陰性試劑對照,自身對照。一般來說,有一個陽性組織對照和一個陰性組織對照就足夠了。定位抗原表達必須在特
如何避免掉進做免疫組化時導致非特異性染色的八大坑?2021/09/08
全國江山一片紅,這可不是閱兵日的朋友圈,而是在做免疫組化啊!好好的一張片子染得臟臟的。一下子整個人都不好了。這里,總結出了導致非特異性染色的八個大坑,以及避免掉坑里的一些做法。皆是獨門絕技,不要眨眼咯!1、抗體問題,真的是一分錢一分貨一抗用多克隆抗體容易出現非特異性染色,建議用高純度,高效價的針對更具特異性抗原決定簇的單克隆抗體來解決。單克隆抗體很貴,不過結果真的很好。尤其是背景非特異性染色不會太深。真是一分價錢一分貨。一抗過期也會造成杯具,所以要注意抗體的有效期。2、抗體濃度過高/孵育時間過長
發高分 SCI,不會免疫組化(IHC)怎么行?2021/09/07
相信大家對IHC一定不陌生,世界那么大,實驗方法層出不窮,但是免疫組化卻是經典中的經典,想看看別的高大上的技術?不急,我們先來復習復習免疫組化。免疫組化,免疫組織化學技術(immunohistochemistry),是一項利用抗原抗體反應,通過使標記抗體的顯色劑顯色來確定組織細胞內抗原,對蛋白定位,定性的實驗技術。免疫組化主要用的是組織標本和細胞標本兩大類,組織標本包括石蠟切片(病理切片和組織芯片)和冰凍切片。石蠟切片,對組織形態保存好,保存時間也長,雖然對組織抗原暴露有影響,但可以抗原修復,所
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