磁水凈化技術作為磁分離技術應用于水處理工程的一門新興技術，其本質是利用污染物的凝聚性和對污染物的加種性，凝聚性是指具有鐵磁性或順磁性的污染物在磁場作用下，由于磁力作用凝聚成表面直徑增大的粒子而后除去;加種性是指借助于外加磁性種子以增強弱順磁性或非磁性污染物的磁性而便于用磁分離法除去，或借助外加微生物來吸附廢水中順磁性離子，再用磁分離法除去離子態順磁性污染物。磁水凈化技術作用原理與磁選技術相同，但其應用的基礎條件較磁選技術存在區別。