自體螢光（Endogenous fluorescence）
生物組織本身通常即含有可以以雙光子激發的螢光分子，胺基酸中的tryptophan和tyrosine都會發光。但是胺基酸的單分子吸收波長大約在 250 ~ 300 nm的范圍，也就是500 ~ 600 nm的雙光子吸收，通常雙光子顯微系統所使用的雷射可用波長并不包括這個波長。且因為胺基酸在生物各部為的分佈密度差異不大，從而得到的螢光分佈也并不是特別有意義。
LG-1立式光學計技術規格：
1、被測件zui大長度：180mm
2、直接測量范圍：±0.1mm
3、分劃板分度值：1um
4、總放大倍數：1000X
5、測量壓力：（2±0.2）N
6、示值變動性：0.1 μm
7、zui大不準確度：±0.25 μm
8、讀數方式：分劃板讀數
9、zui大測量誤差：±（0.5 L/100） μm L是被測長度,以mm計
10、儀器體積：340*160*410mm
11、儀器重量：30kg

LG-1立式光學計標準配件：
1、可調帶筋園臺
2、可調園平臺
3、帶筋固定方臺
4、平面測帽 Ф2
5、平面測帽 Ф 8
6、小球面測帽
7、刃形測帽

 生物體中常用的高能量分子NADPH與NADH也會產生螢光。獨立的NAD（P）H吸收譜線為340 nm并放出460 nm的螢光，衰滅時間400皮秒。與其他分子結合的NAD（P）H之螢光光譜會藍移，且衰滅時間延長到2奈秒。高新成代謝率的區域因為有高濃度的NAD（P）H，所得影像亮度較高。NAD（P）H的螢光因此可用來監測角膜與皮膚中的氧化還原態。在粒線體中濃度特別高的黃素蛋白（flavoprotein）（生化反應中電子傳遞鍊上的能量分子）也可用于雙光子螢光顯微，其單光子的吸收譜線在450 nm，放出550 nm的螢光。

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