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蛋白質定量技術:方法、優勢與應用檢測技術服務詳情介紹
在現代生物醫學研究中,dànbáizhì被視為細胞功能的直接體現者。無論是探究疾病的分子機制,還是開發jīngzhǔn醫療方案,研究者都必須深入了解dànbáizhì在不同條件下的表達變化。因此,dànbáizhì定量技術逐漸成為生命科學研究中bùkěhuòquē的一環。
一、dànbáizhì定量的科學意義
dànbáizhì定量,即對特定生物樣本中目標蛋白的豐度進行數值化測量。在生理和病理過程中,蛋白表達常伴隨著顯著波動,通過定量分析可以反映出基因表達后的實際功能狀態。與轉錄組或基因組數據相比,dànbáizhì水平的數據更加接近表型層面,是連接基因調控與細胞功能的關鍵橋梁。例如,兩個組織樣本即便在mRNA水平無明顯差異,但在蛋白水平上可能存在顯著表達失衡,這種“轉錄后調控”現象往往對疾病發生發展至關重要。
二、dànbáizhì定量方法概覽
當前常用的dànbáizhì定量方法主要可分為三大類:基于標記的方法、無標記方法,以及靶向質譜定量方法。不同策略適用于不同的研究目標、樣本類型和預算考量。
1、基于同位素標記的方法
??TMT/iTRAQ
TMT(Tandem Mass Tags)和iTRAQ(Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantification)均屬于同位素標簽定量技術,通過將不同樣本中的肽段打上不同的同位素標簽,實現樣本在同一質譜實驗中的并行分析。
優勢:
可一次性分析8至16個樣本,效率高
數據一致性強,適合處理臨床隊列
常與高分辨率Orbitrap平臺聯用,提高定量精度
限制:
存在比值壓縮(ratio compression):共洗脫干擾信號會影響定量準確性。
成本較高:標簽試劑價格昂貴。
對樣本質量和酶解效率要求高,前處理復雜。
??SILAC
SILAC(Stable Isotope Labeling by Amino acids in Cell culture)采用體內標記原理,直接將含13C或15N的氨基酸引入細胞培養中,生成“輕重肽”差異,適合細胞系蛋白表達動態研究。
優勢:
生物學背景統一,變異少
非侵入性,標記效率幾乎100%
適合研究信號通路激活、蛋白互作動態等
限制:
不適用于組織、體液等非培養類樣本
培養時間長,且部分細胞系對標記氨基酸適應性差。
2、無標記定量(Label-Free Quantification, LFQ)
LFQ是目前應用zuì廣泛的dànbáizhì定量策略之一。它不需要任何化學或同位素標簽,而是依賴于肽段在質譜中的離子強度或譜圖數進行相對定量。
優勢:
樣本處理流程簡單,成本低
樣本類型兼容性強(適用于血清、組織、細胞、外泌體等)
適合開展大規模樣本探索研究
限制:
定量精度受質譜穩定性影響大:對LC-MS/MS平臺一致性要求高。
動態范圍有限:極低豐度蛋白可能被漏檢。
批間差異需嚴格控制,通常需設置內部標準或偽重抽樣策略以提升可信度。
3、靶向定量
當研究進入蛋白驗證階段,尤其需要高特異性與高重復性的定量方法時,MRM(Multiple Reaction Monitoring)和PRM(Parallel Reaction Monitoring)成為shǒuxuǎn。
??MRM
MRM常用于蛋白驗證與臨床轉化研究。其原理是通過選擇性地監測特定肽段及其碎片離子的特征對,實現高靈敏度檢測。
優勢:
極低的背景干擾
良好的定量線性范圍
適合juéduì定量,結合內標后可提供ng/mL級別的精度
限制:
建立方法復雜:需針對每個目標肽段進行優化。
一次性分析蛋白數量有限:通量受限于質譜循環速度。
不適合探索性研究,僅適用于已知目標。
??PRM
PRM利用高分辨質譜全面掃描目標肽段的所有碎片離子。
優勢:
分辨率高,干擾更少。
數據更全面,便于后期數據驗證與復用。
適合靶標驗證與轉化研究過渡階段。
限制:
對儀器性能要求高:需高分辨率質譜支持。
數據分析較為復雜,對信息學工具依賴程度高。
三、dànbáizhì定量的典型應用場景
1、疾病分子機制研究
通過分析患者與正常對照樣本中的蛋白表達差異,可揭示疾病關鍵通路及核心調控節點。例如,乳腺癌亞型間蛋白表達譜存在顯著差異,為jīngzhǔn分型和治療靶點識別提供理論依據。
2、生物標志物篩選與驗證
從Discovery階段的大規模篩選(如LFQ或TMT),到PRM/MRM驗證,蛋白定量技術構成了完整的標志物研究鏈條,推動基礎成果向臨床應用轉化。
3、藥物作用機制與療效評估
在藥物研發中,研究者常利用蛋白定量分析藥物處理前后的蛋白變化,揭示其作用靶點、影響通路,評估療效和毒性。
4、微生態與免疫互作研究
蛋白定量結合代謝組與轉錄組等技術,能夠系統地剖析宿主-微生物-免疫系統間的相互作用,已廣泛應用于腸道疾病、自身免疫病研究中。
從揭示細胞應答機制,到識別臨床診斷標志物,再到推動個體化治療策略建立,蛋白定量的價值正日益凸顯。無論是高通量的iTRAQ/TMT、靈活便捷的LFQ,還是jīngquè靶向的MRM/PRM,不同dànbáizhì定量方法在各自應用場景中都展現出dútè優勢。百泰派克生物科技基于優良的質譜平臺與成熟的數據分析體系,為科研人員提供靈活、高效、定制化的定量蛋白組分析服務,助力您的每一次科學發現更進一步。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!