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交聯法蛋白相互作用分析檢測技術服務詳情介紹
生理條件下,大多數蛋白質間相互作用持續時間很短,從而使得相互作用研究變得很困難。交聯試劑為這一問題提供了解決方案,即在蛋白質相互作用時將它們共價交聯在一起,捕獲蛋白質-蛋白質復合物,凍結短暫微弱的相互作用,從而實現對短暫相互作用蛋白的分離和表征。交聯過程在體內或體外都可以進行,使用體內還是體外交聯取決于項目的需求。兩者區別在于,蛋白質在體內交聯過程中以天然狀態交聯,而對于體外交聯,蛋白質可能會發生變性。 體內交聯 體內交聯反應的過程中,蛋白質交聯反應發生在細胞內部,因此可以消除假陽性的相互作用及蛋白質復合物穩定性喪失的風險。位于細胞膜內的蛋白質通常使用疏水性和脂溶性交聯劑進行交聯反應,而位于細胞膜上的蛋白質(如血漿錨定的受體)通常使用親水性和水溶性交聯劑進行交聯反應。盡管蛋白質保持天然狀態,但由于細胞中蛋白質的復雜性,體內交聯的優化過程也可能很復雜,仍然存在發生非特異性交聯反應的可能性,可以通過使用間隔臂較短的交聯劑來消除非特異性交聯的問題。 體外交聯 在體外交聯過程中,細胞被均質化,裂解。因此,該方法更適合分析較穩定的蛋白質-蛋白質相互作用。由于在特定的裂解緩沖液中對細胞進行裂解,想要對反應條件進行控制變得比較容易,如溫度、pH、離子強度等反應條件都可以進行調整。因為不在受到體內環境的限制,也有更多類型的交聯劑可供選擇,也可以更好的控制非特異性交聯。
交聯法蛋白質相互作用分析
常見交聯類型
化學交聯 化學交聯劑通過在兩個或多個生物分子的特定氨基酸官能團之間形成化學鍵而將相互作用的蛋白質、結構域或多肽共價連接在一起,這些分子由于相互作用而緊密相鄰。根據項目的具體要求,許多商業化的化學交聯劑可供選擇,包括同源雙功能或異源雙功能交聯劑,長臂或短臂交聯劑,可裂解或不可裂解交聯劑,水溶性或非水溶性交聯劑等等。同源雙功能分子靶向蛋白質上相同的功能基團,而異源雙功能交聯劑能夠靶向不同蛋白質上的不同官能基團,可以實現更大的變異性或特異性交聯。交聯劑分子也可以設計成包含可裂解的元素,如酯或二硫鍵,以分別通過添加羥胺或還原劑來逆轉或破壞連接。疏水性的交聯劑,可以進入疏水性蛋白質結構域或穿過細胞膜;親水性的交聯劑,可以限制交聯至水性環境。 光敏交聯 由于將交聯劑添加到細胞懸液或細胞裂解物中可能導致許多非特異性交聯的形成,為了更好的分析蛋白質-蛋白質的相互作用,還通過添加光敏基團等方式,設計了更復雜的交聯劑。這些光敏基團僅在選定的時間內發生反應,并僅對紫外線照射發生響應。一端具有化學交聯基團而另一端具有光敏基團的異源雙功能交聯劑可通過兩個步驟與選擇的目標蛋白發生反應。
交聯法蛋白相互作用分析的特點
• 可對體內瞬時蛋白質間相互作用進行分析 • 可對低親和力的體外蛋白質間相互作用進行分析 • 高檢測靈敏度
交聯法蛋白相互作用分析的一般工作流程
根據您的特定項目需求設計交聯方法和交聯劑類型:體內/體外; 2. 反應條件優化,有針對性的結合樣品特性及項目需求,對實驗條件進行優化; 3. 細胞裂解,CoIP; 4. 蛋白免疫印跡/質譜分析(根據項目需求而定); 5. 數據分析及報告交付。
交聯法蛋白相互作用分析一站式服務
您只需下單-寄送樣品 百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-數據分析-項目報告
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對蛋白質序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對蛋白質的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質N端序列分析服務。對于未知理論序列的蛋白質,提供基于從頭測序法的蛋白質從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白質組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量蛋白質組學、靶向蛋白質組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種蛋白質組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種蛋白質標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術優良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋蛋白質組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!