靶基因甲基化測序（Target-BS）
- 公司名稱 深圳市易基因科技有限公司
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- 廠商性質 生產廠家
- 更新時間 2023/3/3 17:08:22
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大家好，這是專注表觀組學十余年的易基因。
對目標基因/CpG 位點甲基化檢測，建立靈活的靶向甲基化測序技術。
易基因建立的靶基因甲基化高通量測序（Target Bisulfite sequencing，Target-BS）是針對已有目標基因panel組合，運用易基因自主研發的甲基化特異性多重PCR引物設計軟件，對亞硫酸鹽轉化后的目標基因多重擴增，建庫后進行超高深度（1000X以上）甲基化精準檢測。
應用方向：
Target-BS廣泛用于已知位點的甲基化Biomarker篩選、驗證及臨床轉化應用
后續目標基因的甲基化驗證
技術優勢：
多基因多重擴增，檢測通量高；
超高深度亞硫酸鹽甲基化測序，相對于傳統BSP克隆測序，檢測靈敏度、準確性高，可準確檢測到樣本中低于1%的甲基化水平；
樣本需求量低，20ng基因組DNA可實現多基因擴增；
適用范圍廣，對基因組DNA、FFPE樣本、游離cfDNA等樣本均適用；
檢測費用顯著低于現有技術、快周期。
技術路線：
實驗策略：
分析內容：
送樣要求：
經典案例：
參考文章
Vitamin C Prevents Offspring DNA Methylation Changes Associated with Maternal Smoking in Pregnancy
靶基因DNA甲基化測序驗證補充維C可減少后代因母親妊娠期吸煙而發生的DNA甲基化變化
背 景：
妊娠期吸煙可能導致嬰兒出生后終生肺功能下降。此前已有不少研究描述了孕婦吸煙相關的的DNA甲基化變化，如在分娩時的胎盤和臍血、胎兒肺以及兒童時期的口腔上皮和血液中。本研究為確定補充維生素 C 是否會減少后代因母親因妊娠期吸煙而發生的甲基化變化。
方 法：
對胎盤、臍帶血樣本和口腔樣本進行靶向重亞硫酸鹽測序，然后使用靶基因DNA甲基化測序對選定的臍帶血差異甲基化區域進行獨立驗證。
結論：
安慰劑組和非吸煙者組之間甲基化差異≥10%的大多數CpG（69.03%）在補充維生素C后，至少50%可恢復到非吸煙者水平。恢復的CpG中有相當一部分與低甲基化CpG富集程度較高的表型結果相關。
靶基因DNA甲基化測序覆蓋的所有321個CpG是平均覆蓋深度的 337 倍
Target-BS用于甲基化多位點甲狀腺結節診斷
Target-BS發現食管鱗癌甲基化 biomarker
參考文獻：
①Targeted bisulfite sequencing identified a panel of DNA methylation-based biomarkers for esophageal squamous cell carcinoma (ESCC)，DOI 10.1186/s13148-017-0430-7
②Identification of Tissue-Specific DNA Methylation Signatures for Thyroid Nodule Diagnostics，DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-18-0841
③Investigation of measurable residual disease in acute myeloid leukemia by DNA methylation patterns，doi.org/10.1038/s41375-021-01316-z
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