如何解讀Qubit RNA IQ Assay Kit的檢測結果?
Invitrogen Qubit RNA IQ Assay Kit 是一種用于精確檢測 RNA 質量和濃度的工具,以下是對其檢測結果解讀的一些要點:
濃度
數值含義:檢測結果會給出 RNA 的濃度值,單位通常是 ng/μL。這個數值表示每微升樣品中所含 RNA 的質量。
準確性:Qubit 系統采用熒光染料特異性地結合 RNA,能提供高精度的定量結果,受雜質干擾小,比傳統的紫外分光光度法更準確。例如,若紫外分光光度法檢測結果受蛋白質等雜質影響而偏高,Qubit RNA IQ Assay Kit 則能排除此類干擾,給出更真實的 RNA 濃度值。
RNA 完整性數(RIN)
數值范圍與意義:RIN 值范圍從 1 到 10,10 代表最完整的 RNA,通常認為 RIN 值≥7 表示 RNA 質量較好,適用于大多數下游應用,如 qRT - PCR、微陣列分析等;RIN 值在 5 - 7 之間,說明 RNA 有一定程度的降解,但可能仍適用于一些對 RNA 完整性要求不太高的實驗,如普通 RT - PCR;RIN 值<5 則表明 RNA 降解嚴重,可能會影響實驗結果的準確性和可靠性。
評估方法:該試劑盒通過分析 RNA 電泳圖譜中 28S 和 18S rRNA 的相對強度以及它們與其他 RNA 條帶的分布情況來計算 RIN 值,能直觀地反映 RNA 的完整性。
28S/18S 比值
正常范圍:對于真核生物,完整的 RNA 通常具有 28S/18S 比值在 1.8 - 2.2 之間。
比值變化含義:比值高于 2.2 可能表示 RNA 有降解,導致 18S rRNA 丟失相對較多;比值低于 1.8 可能意味著存在 RNA 的部分降解或污染,例如,可能有基因組 DNA 污染,影響了 28S rRNA 的條帶強度,或者 RNA 在提取過程中受到了機械剪切力等因素的影響,使 28S rRNA 斷裂,從而降低了該比值。
在解讀檢測結果時,需要綜合考慮濃度、RIN 值和 28S/18S 比值等多個指標,以全面評估 RNA 的質量和濃度是否滿足實驗需求。同時,還應結合實驗目的和后續應用來判斷 RNA 樣品是否合格。例如,對于構建 cDNA 文庫,通常需要高質量、高濃度且完整性好的 RNA,即 RIN 值較高、28S/18S 比值正常且濃度足夠的樣品;而對于一些簡單的基因表達分析實驗,對 RNA 質量的要求可能相對寬松一些。
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