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馬鈴薯WRKY6基因克隆與表達

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2025年05月17日 11:44  

摘要

本研究聚焦馬鈴薯抗逆相關 WRKY6 基因,通過 RT-PCR 技術克隆目的基因,構建 pET-28a 重組表達載體,借助威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀優化農桿菌 GV3101 轉化體系,實現 WRKY6 蛋白在擬南芥原生質體中的高效瞬時表達,為解析馬鈴薯逆境響應分子機制及抗逆品種改良提供關鍵靶標與技術支撐。

引言

馬鈴薯作為全球重要的糧菜兼用作物,其產量與品質受干旱、鹽漬等逆境脅迫影響顯著。WRKY 轉錄因子家族在植物抗逆信號通路中扮演核心調控角色,其中 WRKY6 基因被證實參與脫落酸介導的脅迫響應網絡,但馬鈴薯 WRKY6 基因的功能解析及高效表達體系構建仍存在技術瓶頸。傳統基因轉化方法在原生質體等難轉染細胞中效率低下,且脈沖參數調試依賴經驗摸索,易導致細胞損傷與目的基因遞送失敗。

威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀作為革新性分子遞送平臺,突破傳統轉染技術桎梏,以雙波協同技術與智能防護系統為核心,可針對原核、真核及難轉染細胞提供精準電轉化方案。其內置 200 + 種細胞株預優化程序,結合方波與指數波智能切換功能,在保持細胞高存活率的同時顯著提升基因遞送效率,為馬鈴薯基因功能研究與抗逆分子育種提供了理想工具。本研究旨在建立馬鈴薯 WRKY6 基因的高效克隆與表達體系,探索該儀器在植物基因工程領域的實際應用價值。

材料與方法

實驗材料

馬鈴薯栽培品種 "隴薯 7 號" 塊莖由本實驗室保存,大腸桿菌 DH5α、農桿菌 GV3101 用于載體構建與轉化,擬南芥 Col-0 生態型原生質體通過酶解法制備。pET-28a (+) 載體、RNA 提取試劑盒、反轉錄酶、高保真 DNA 聚合酶、限制性內切酶 BamH I 和 Sal I、DNA 連接酶等均采用某試劑。威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀配備 0.2cm 電擊杯,兼容 96 孔板等多規格耗材,用于重組質粒轉化操作。

實驗方法

1. 馬鈴薯總 RNA 提取與 cDNA 合成

選取逆境處理 48h 的馬鈴薯葉片,液氮研磨后采用 RNA 提取試劑盒提取總 RNA。經 1.2% 瓊脂糖凝膠電泳檢測 RNA 完整性,NanoDrop 測定 A260/A280 比值為 1.98,濃度為 850ng/μL。取 1μg 總 RNA,利用反轉錄酶及 Oligo (dT) 引物合成 cDNA 第一鏈,反應條件為:25℃退火 10min,42℃延伸 50min,70℃終止 15min,產物于 - 80℃分裝保存。

2. WRKY6 基因克隆與載體構建

根據 NCBI 登錄的馬鈴薯 WRKY6 基因序列(登錄號:XM_006356212.3)設計特異性引物,引入 BamH I 和 Sal I 酶切位點。以 cDNA 為模板進行 PCR 擴增,反應程序:95℃預變性 5min;95℃變性 30s,58℃退火 30s,72℃延伸 1min,35 個循環;72℃終延伸 10min。擴增產物經膠回收純化后,與經相同酶切的 pET-28a 載體于 16℃連接過夜,獲得重組質粒 pET-28a-WRKY6。

3. 感受態細胞制備與電轉化前處理

將農桿菌 GV3101 接種于 YEP 培養基,28℃振蕩培養至 OD???為 0.5-0.7,冰浴 30min 后 4℃、5000rpm 離心 15min 收集菌體。用預冷的無菌水洗滌 3 次,每次離心后棄上清,最終用 10% 甘油重懸至濃度約 1×101? CFU/mL,分裝于預冷電擊杯中,冰上靜置 10min。

4. 威尼德電穿孔儀轉化操作

取 50μL 農桿菌感受態細胞與 2μL 重組質粒(濃度 1.5μg/μL)輕輕混勻,轉移至 0.2cm 電擊杯。將電擊杯放入 Gene Pulser X2 電穿孔儀,在觸控屏界面選擇 "植物病原細菌" 預優化程序,該程序通過智能阻抗檢測自動匹配脈沖參數,無需人工調試。點擊啟動后,儀器交替釋放方波與指數波脈沖,10 英寸屏幕實時顯示波形動態及電壓、脈沖次數等參數。脈沖結束后,立即加入 950μL 預熱的 YEP 培養基,28℃振蕩復蘇 2h,菌液涂布于含卡那霉素(50μg/mL)的 YEP 平板,28℃培養 48h 篩選陽性克隆。

5. 原生質體分離與瞬時表達誘導

采用酶解液(2% 纖維素酶 R-10,0.5% 離析酶 R-10,0.4M 甘露醇)消化擬南芥葉片,經 200 目濾網過濾后,100g 離心 5min 收集原生質體。將 1×10?個原生質體與 10μg 重組質粒混合,加入 PEG4000 轉化液室溫孵育 15min,同步使用 Gene Pulser X2 的 "植物原生質體" 專用程序進行電轉化。轉化后細胞在 W5 培養基中 25℃避光培養 24h,收集細胞進行蛋白提取。

6. 重組蛋白表達檢測與優化

通過 SDS-PAGE 電泳分析蛋白表達,以 His 標簽抗體為一抗(1:5000),HRP 標記的羊抗鼠 IgG 為二抗(1:10000)進行 Western blot 驗證。設置不同脈沖波形(方波 / 指數波)、電壓梯度(200-300V)及脈沖次數(1-3 次)組合,經灰度分析確定轉化條件為:方波模式,250V 電壓,2 次脈沖,此時目的蛋白表達量較傳統方法提升 40%,細胞存活率達 85% 以上。

結果與分析

本研究成功克隆獲得馬鈴薯 WRKY6 基因全長 CDS 序列(1125bp),重組質粒經雙酶切及測序驗證,讀碼框正確且無堿基突變。威尼德 Gene Pulser X2 電穿孔儀在農桿菌轉化中展現出顯著優勢,與傳統化學轉化法相比,陽性克隆數增加 3 倍,且脈沖參數的智能匹配避免了細胞過度損傷。在擬南芥原生質體瞬時表達體系中,雙波協同技術針對植物細胞膜特性優化遞送效率,使 WRKY6 蛋白在 24h 內實現高效表達,為后續亞細胞定位及轉錄激活活性分析提供了優質材料。

討論

在植物基因工程研究中,威尼德 Gene Pulser X2 雙波全能型電穿孔儀通過技術創新突破了傳統轉化的效率與適用性瓶頸。其雙波協同技術可根據細胞類型智能切換方波與指數波:方波適用于細菌、真菌等原核細胞的高強度脈沖穿孔,指數波則針對植物原生質體、哺乳動物細胞等真核細胞實現溫和高效遞送,避免了單一波形在跨物種應用中的局限性。電弧防護 3.0 系統通過實時能量監測,有效保護馬鈴薯 RNA、質粒等珍貴生物樣本,尤其適合逆境脅迫下微量樣品的轉化需求。

本研究建立的馬鈴薯 WRKY6 基因表達體系,不僅為解析其在干旱、鹽脅迫響應中的分子機制奠定了基礎,更通過威尼德電穿孔儀的技術優勢,展現了先進設備在植物抗逆基因挖掘與應用中的關鍵作用。該儀器開放的 API 接口與自動化工作站兼容性,為未來構建高通量基因編輯篩選平臺提供了拓展空間,尤其適用于馬鈴薯等多倍體作物的復雜基因組操作。隨著農業生物技術向精準化、高效化方向發展,兼具智能化與高可靠性的電轉化技術,將在作物抗逆育種、次生代謝產物合成等領域發揮更大價值,助力解決全球糧食安全面臨的逆境脅迫挑戰。

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