齒深較深：能形成更深的加樣孔，自然可以容納更多的樣品。這對于樣品量充足且需要上樣較大體積的情況很有幫助，例如在蛋白質表達量分析實驗中，較多的樣品可以使檢測結果更靈敏，有利于觀察到低表達量的蛋白質。

齒深較淺：加樣孔淺，容納的樣品量就有限。如果樣品量較多，可能需要多次加樣，這不僅操作繁瑣，還可能因多次加樣引入誤差，如每次加樣量不一致，導致不同泳道上樣量存在差異，影響結果的準確性和可比性。

齒深較深：樣品在深孔底部的擴散空間更大，從加樣開始到電泳結束，樣品分子有更多機會在孔內擴散。尤其是在電泳起始階段，樣品還未進入凝膠基質時，擴散會使條帶的起始位置變得模糊，對后續準確測量條帶遷移距離和分析結果造成一定干擾。

齒深較淺：淺孔限制了樣品的擴散空間，樣品在加樣后能更快地進入凝膠進行電泳分離，條帶的起始位置相對清晰，有利于準確測量條帶遷移距離，為精確分析樣品的分子量等特性提供了更好的基礎。

齒深較深：由于樣品在深孔中擴散相對嚴重，進入凝膠后條帶可能會變寬，并且深孔使樣品在凝膠中的分布相對較分散，導致條帶的邊緣不夠清晰，影響對條帶的觀察和分析，尤其對于分子量相近的樣品，可能難以準確區分。

齒深較淺：淺孔使樣品在凝膠中的起始分布相對集中，經過電泳分離后，條帶相對狹窄且邊緣清晰，能夠提高分辨率，更有利于區分不同分子量的樣品條帶，對于需要精確判斷條帶位置和大小的實驗，如 DNA 片段的精確分析，淺齒梳子更具優勢。

齒深較深：深孔為樣品提供了更多的分離空間，對于一些分子量較大或結構復雜的樣品，在電泳過程中可能有更充足的時間和空間進行分離，減少因空間限制導致的分離不現象，從而在一定程度上提高分離效果。

齒深較淺：淺孔提供的分離空間相對有限，對于一些復雜樣品或高分子量樣品的分離可能不夠充分。但對于分子量較小且結構簡單的樣品，淺孔通常能夠滿足分離要求，并且由于其限制了樣品的擴散，反而可能使分離效果更好，條帶更加集中。

齒深較深：深齒梳子在插入和拔出凝膠時，對凝膠的損傷相對較大。一方面，插入時可能會使凝膠內部產生較大的應力，導致凝膠結構出現微小的裂縫或不均勻性；另一方面，拔出時也更容易拉扯凝膠，使加樣孔周圍的凝膠結構變得疏松，這些都會影響凝膠的整體結構穩定性，進而影響電泳過程中電場的均勻性和樣品的遷移行為，降低實驗的重復性。

齒深較淺：淺齒梳子對凝膠的損傷較小，插入和拔出過程中引起的凝膠結構變化相對輕微，凝膠表面相對平整，內部結構也較為均勻，能夠更好地維持電場的均勻性，保證樣品在電泳過程中的遷移行為較為穩定，從而提高實驗的重復性和結果的可靠性。