通風柜不是一臺單獨的設備，外部環境的變化會影響通風柜的性能。同時，二級生物安全柜通風柜以及其控制系統也會影響他周圍的環境，當您在選擇通風柜時首先：必須考慮到整個系統的因素，例如：實驗室的空間、建筑物的通風控制系統、排氣管路的安排以及通風柜的擺放等等。其次:您需要確定所需的是哪一類型的通風柜，在選擇時，通常您可以按照以下因素來衡量： 
1.上柜部分： 
有三種樣式：標準式、臺式、落地式。 
通風柜的表面風速是否達到標準規定的安全風速要求：0.5m/s（標準規定：只有表面風速達到了0.5m/s才可以有效的捕捉柜內的有害氣體）。 
通風柜的開口高度是否適滿足您對操作空間的需求。 
通風控制系統：定風量高壓蒸汽滅菌器、變風量還是自適應性控制系統。 
內襯板材質：抗倍特板、實芯理化板、中密度外貼理化板等等。 
調節門的原料是否采用了加強型鋼化玻璃，其設計是否符合人體力學，使操作者拉動自如。 
2.臺面部分： 
臺面是否采用了安全的碟狀設計，從而方便用戶清潔臺面和防止毒性液體的外漏。 
臺面的材質是否符合您實驗的需求抵抗相應的腐蝕和高溫。 
是否安裝了杯槽或是水槽，且安裝的位置是否合理。 
出風口的設計是否合理。 
3.底柜部分： 
材質是否堅固耐用，是否為防火材料，是否可以抵抗實驗室的酸堿環境對他的腐蝕。 
電源供給是否合理、安全。 
是否便于維修水、電、氣系統。 
底柜是否需要抽氣設計，以便您放置揮發性的藥品。 
當您基本選擇好了通風柜的型號、樣式和尺寸之后，可以根據以下條件來確定您所需的。 
4.附屬配件： 
水來源：蒸餾水、純水或是逆滲透水等等。 
氣來源：氮氣、氧氣或是空氣等等。 
電氣系統的選擇則要考慮：型號、電壓大小、防暴性、耐用性等等。 
出于美觀，是否需要封板。