在RNA的提取過程中,外源物質的引入、操作不規范、內外源性核酸酶的影響,都會導致RNA的降解,影響提取質量。利用核酸電泳可以判斷RNA的完整性,通過分光光度計可以驗證RNA的濃度和純度。
在超微量分光光度計上,加入1-2微升的RNA提取樣本就可以進行光吸收的檢測。從結果中我們可以得到RNA的光譜圖、濃度、a260/280的比值、a260/230的比值。
不同物質有不同的吸收波長:
A260nm是核酸吸收峰的吸收波長;A230nm是碳水化合物和鹽等的吸收波長;A280nm是蛋白和酚類物質吸收峰的吸收波長。
由于樣品差異,我們提取的RNA濃度不一,需要根據目的基因表達水平及預實驗來確定最合適的RNA濃度。
除了濃度之外,我們還會得到A260/280和A260/230兩個比值,這兩個參數是核酸純度的指示值。
純凈的RNA樣品A260比A280接近2.0。如果比值低于1.8,表示存在蛋白或酚類物質的影響;如果比值大于2.2,表明RNA已經發生了降解。所以比值范圍在1.8-2.2這個范圍內,結果都是合格的。
純凈的RNA樣本的A260和A230的比值大于2.0,若比值小于2.0,則表明樣品被碳水化合物(糖類)、鹽類或有機溶劑污染,需要純化樣品。
所以,評判RNA的質量,一定要用超微量分光光度計對RNA濃度和純度的進行驗證哦。只有這些參數都在可用范圍之內,提取到的RNA才是可用的。
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