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顯色培養基是用于微生物選擇性生長和鑒定的微生物培養基，這種細菌的代謝物與顯色指示劑發生反應，從而改變顯色指示劑的顏色。總之，以上就是利用生化反應的特異性來識別細菌，核心是酶。
微生物代謝的酶與相應的顯色底物發生特異性反應，使菌落呈現鮮艷的顏色。這些相應的顯色底物由顯色基團和微生物的一些可代謝物質組成。在特定酶的作用下，游離的顯色基團顯示出一定的顏色，從而可以通過直接觀察菌落顏色來鑒定菌株。使用顯色培養基篩選和分離微生物的反應靈敏度和特異性遠優于傳統培養基。
顯色培養基使用特定細菌屬的細胞質中所含的特定酶。這種細菌含有的這種酶越多，使用這種酶進行鑒定的準確性和特異性就越高。將酶的特定顯色底物添加到培養基中。當這種細菌大量生長時，顯色底物滲入細菌體內，被酶裂解產生顏色，使菌落也帶顏色。在培養基中加入抗生素或膽汁鹽混合物，以抑制其他無關細菌的生長，即提高選擇性，或調整培養基中的營養。一些不相??關的細菌因缺乏營養而不能生長，但目標細菌的營養可以在培養基中得到滿足，因此它們可以生長。
有些顯色培養基可以讓幾種細菌同時生長和識別，從而使這些細菌產生不同的顏色。這是因為這些細菌攜帶不同的代謝酶，同時在培養基中加入顯色混合物，即這些酶的顯色底物。當它們被裂解時，顏色不同，因此可以區分它們。
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