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對浮游菌采樣器的校準(zhǔn)過程存在兩種方法，分別為對目標(biāo)采樣時間和目標(biāo)采樣流量的調(diào)節(jié)；從而滿足目標(biāo)總采樣體積的要求。
方法1：將實(shí)測流量值輸入采樣器，即實(shí)際流量值修正。通過調(diào)整采樣時間，即使實(shí)測流量比預(yù)設(shè)流量差很多，仍然保障采樣總體積的準(zhǔn)確性。
方法2：通過調(diào)節(jié)風(fēng)機(jī)功率來調(diào)節(jié)并達(dá)到目標(biāo):采樣流量，即目標(biāo)流量值調(diào)節(jié)。該方法根據(jù)調(diào)節(jié)步驟又分為硬件調(diào)節(jié)和軟件調(diào)節(jié)。
對于普通的大氣采樣器，方法1是合適的，因?yàn)樗鼜?qiáng)調(diào)累積采樣體積的準(zhǔn)確性。但對于浮游菌采樣器，不僅采樣體積是重要的，采樣流量也是重要的，因?yàn)樗抢冒驳律矒粼恚瑢⒖諝庵懈∮尉矒舨杉江傊线M(jìn)行培養(yǎng)計(jì)數(shù)的。
由于這種收集跟微粒的大小和撞擊速度有關(guān)，而和采樣時間無關(guān)。因此，如果采樣流量發(fā)生大的偏差(一般偏小)，即使方法1得到的最終采樣體積是準(zhǔn)確的，但由于撞擊速度不夠，只有大微粒被捕集，而小微粒被漏掉，測量結(jié)果不準(zhǔn)確，可能會造成大的損失。
一般來說，負(fù)載能力強(qiáng)的采樣器，可直接與傳統(tǒng)氣體采樣器流量校驗(yàn)裝置連接和檢測。低負(fù)載浮游菌采樣器，只能利用基于葉輪風(fēng)速計(jì)或羅茨流量計(jì)原理的校準(zhǔn)裝置進(jìn)行檢測，兩種裝置各有利弊。
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