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作為離子色譜的心臟，ThermoFisher色譜柱一直是影響離子色譜分析結果的一個重要因素，因此幾乎所有的離子色譜儀器生產廠家都將離子色譜柱列入重要指標，同時又有眾多的廠家研制和生產不同用途、不同分離機理的離子色譜柱。
目前，離子色譜用的ThermoFisher色譜柱主要由一定內徑的柱管加上不同類型的填料所組成，針對離子色譜流動相比較多的采用酸、堿、鹽的特點，目前多數離子色譜柱管材料由PEEK材料所組成（少數廠家也采用不繡鋼作為材料），隨著離子色譜對柱效要求的提高，離子色譜所有的填料顆粒也越來越小，同時也對柱管所能夠承受的壓力要求越來越高，新型的離子色譜要求能夠承受40MPa的壓力。
ThermoFisher色譜柱的維護保養：
（1）接ThermoFisher色譜柱前確保系統已清洗干凈。ThermoFisher色譜柱在任何情況下不能碰撞、彎曲或強烈震動；很多單位的離子色譜儀是陰、陽離子混用的，因此，接色譜柱前，一定要保證整個離子色譜儀上的所有閥件或管路已清洗干凈，避免造成色譜柱堵塞。
（2）確保ThermoFisher色譜柱不進入顆粒物。樣品一定要經過預處理，去除顆粒物等會給泵和色譜柱帶來負擔的物質。
（3）確保ThermoFisher色譜柱不干燥。每天分析工作結束后，要清洗進樣閥中殘留的樣品，還要用適當的溶劑來清洗柱；若分析柱長期不使用，要參照色譜柱保存辦法，在沖洗干凈后，對陰離子柱要通入一定濃度的堿（對陽離子柱要通入一定濃度的酸），并將色譜柱取下兩端密封保存。
（4）確保ThermoFisher色譜柱在一定壓力、流速條件下運行。儀器使用時一定要先檢查整個流動管路中是否有氣泡，如果有，需要先將氣泡排除后再將色譜柱接上，防止將氣泡帶到色譜柱中。因為色譜柱中裝填的樹脂顆粒很小，氣泡進入后將影響樹脂和樣品中離子的交換，同時氣泡也將影響基線的穩定性。
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