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液相質譜儀主要是用到液相色譜儀用作分離系統，質譜用作檢測系統分析檢測樣品。色譜法和質譜法的優點是互補的。適用于非揮發性化合物、極性化合物、熱不穩定化合物、高分子量化合物(包括蛋白質、多肽、聚合物等)的分析測定。目前，它被廣泛應用于食品分析、藥物分析和環分析等環境分析領域。
液相色譜法：
高壓梯度泵流量范圍，梯度曲線，最高壓
柱溫箱的溫度范圍、精度和穩定性、柱溫箱容積
自動進樣器樣瓶數、進樣范圍、線性度和重現性
質譜儀：
離子源類型、界面、傳輸線溫度、離子傳輸管材料、碰撞池技術
質量分析器質量分析器類型、屬性、質量范圍、靈敏度、分辨率、掃描速度
液相色譜儀采購要點
一、分析效率
主要是關注以下參數:最大通道(最小停留時間，最小延遲時間)，MRM測量正負極性切換時間，掃描測量速度等。各個參數的優化選擇可以大大提高用戶的分析測定效率。
二、穩定性
專注于離子化界面是否穩定，能否在長連續或不連續測定序列中得到穩定可靠的數據，碰撞室串擾最小化保證了高定量精度，精確捕捉超快速分析中的尖峰色譜峰，重現性好不好。
三、日常維護
在日常工作中，儀器的維護至關重要。從用戶的角度來看，日常維護是否簡單方便將是考慮的重要因素之一。如果太復雜和復雜，無疑會給用戶帶來額外的負擔。所以如果廠家還能提供定期的上門維修服務，會有很大的好處。
四、操作性
主要是針對質譜工作站軟件。一套好的軟件操作平臺與儀器本身的設計有很大的關系，采購者可以根據自己的需要來操作檢驗質譜工作站：一般要求軟件對分析數據具有可靠的安全性，簡單實用可操作性強，能夠自動編輯分析方法(具有推薦方法)，自動進行數據的采集、處理、分析，自動進行條件優化選擇(很重要)、自動顯示對分析過程各參數的實時監控、自動報警出現的錯誤并提示原因、自動進行QA/QC控制。在實際操作過程中還需關注軟件的流暢性，有些儀器所配置的內存較小，在長時間的使用后經常會出現軟件卡頓甚至死機的情況出現，造成不必要的麻煩。
對于液相色譜儀的指標，驗收，有幾個是比較重要的建議：
(1)靈敏度，要在單位質量分辨率下
(2)分辨率，要指明在哪個具體的質量處
(3)單位質量分辨下的m/z范圍
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