嚴格按照垂直電泳槽的操作流程進行操作，可以規范垂直電泳槽的基本操作，防治人為操作的失誤，確保垂直電泳槽的正常運轉，有利于垂直電泳槽的維護和保養。

垂直電泳槽的操作步驟如下：
   1.清洗部件，部件組裝前要*清洗干凈；
   2.組裝電泳槽；
   3.灌膠，先灌分離膠，待凝固后在灌濃縮膠，灌膠前接通冷卻水，夾緊連接上下貯液槽的兩根橡膠管；
   4.加樣，松開夾子，放掉槽內的蒸餾水，待水流完后，再夾緊夾子，雙手輕輕取出樣品梳子，將孔中的水分吸去，在上下貯液槽中加入緩沖液，液體高度應超過上貯液槽短玻璃板的上緣，用注射器吸取一定量的樣品加到凹型樣品空內；
   5.電泳，上貯液槽導線與電泳儀的負極相連，下貯液槽導線與電泳儀的正極相連；
   6.取出膠板，電泳結束，旋送螺母，去粗膠框，剝出玻璃板；
   7.關閉電源；
   8.使用時，使用人定期查看。