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色譜是一種分離分析手段，分離是核心， 因此擔負分離作用的色譜柱是色譜系統的心臟。對色譜柱的要求是柱效高、選擇性好，分析速度快等。市場銷售的用于HPLC的各種微粒填料如多孔硅膠以及以硅膠為基質的鍵合相、 氧化色譜柱由柱管、柱頭、卡套(密封環)、篩板(濾片)、接頭、螺絲等組成。柱管多用316L不銹鋼制成，壓力不高于70 kg/cm2 時，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內壁多經過拋光。也有人在不銹鋼柱內壁涂敷氟塑料以提高內壁的光潔度，其效果與拋光相同。還有使用熔融硅或玻璃襯里的，多用于微細管和毛細管柱。色譜柱管兩端的柱頭內裝有篩板，是燒結不銹鋼或鈦合金，孔徑0.2~20μm(5~10μm)，取決于填料粒度，目的是防止填料漏出。
色譜柱按用途可分為分析型和制備型兩類，尺寸規格也不同：①常規分析柱(常量柱)，內徑2~5mm(常用4.6mm，國內有4mm和5mm)，柱長10~30cm；②微徑柱(narrow bore，又稱細管徑柱、半微柱semi-microcolumn)，內徑1~2mm，柱長10~20cm；③毛細管柱(又稱微柱mi-crocolumn)，內徑0.2~0.5mm；④半制備柱，內徑>5mm；⑤實驗室制備柱，內徑20~40mm，柱長10~30cm；⑥生產制備柱內徑可達幾十厘米。柱內徑一般是根據柱長、填料粒徑和折合流速來確定，目的是為了避免管壁效應。
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