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凝膠滲透色譜作為凝膠滲透色譜儀的光散射強度檢測器，與濃度檢測器聯用，可測定大分子的分子量，分子量分布以及粒徑信息。與紫外檢測器，以及示差檢測器聯用，可以表征蛋白復合物的分子量，同時得到蛋白以及修飾物各自的分子量信息。與粘度檢測器聯通用，可以得到Mark-Houwink中的k值,a值，判斷樣品的構象。凝膠具有化學惰性，它不具有吸附、分配和離子交換作用。讓被測量的高聚物溶液通過一根內裝不同孔徑的色譜柱，柱中可供分子通行的路徑有粒子間的間隙（較大）和粒子內的通孔（較小）。當聚合物溶液流經色譜柱（凝膠顆粒）時，較大的分子（體積大于凝膠孔隙）被排除在粒子的小孔之外，只能從粒子間的間隙通過，速率較快；而較小的分子可以進入粒子中的小孔，通過的速率要慢得多；中等體積的分子可以滲入較大的孔隙中，但受到較小孔隙的排阻，介乎上述兩種情況之間。
農藥殘留分析是對復雜基質中的痕量組分進行分析，其過程主要包括樣品前處理和測定兩部分。樣品前處理過程的難點是要將多種農藥痕量組分同時提取，并有效地去除雜質，同時又要保持較高的回收率，并且直接關系到農藥殘留分析的準確度和靈敏度。GPC由于其自身的特點在農藥殘留分析前處理中起到了重要的作用，能把農藥殘留物從各種復雜基質中分離出來。GPC技術作為一種樣品前處理的手段，在國外應用已較普通，這方面的研究報道也很多。
總之，GPC在用于測定高聚物分子量及其分子量分布的情況時要注意選擇合適的數據處理方法，GPC還可用于農藥殘留分析的前處理、藥物、化工料料等方面的質量檢測，用戶應根據實際情況合理使用GPC。
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