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離子色譜柱位于進樣器與分析柱之間，是液相色譜分析中重要的色譜耗材，使用保護柱可大大降低分析柱受污染的程度，延長分析柱使用壽命。
離子色譜柱的一些常見的問題分析：
1.柱壓升高
在檢查流路沒有阻塞的前提下，更換離子色譜柱過濾網板，一般情況下更換保護柱進口端的網板。
2.分離度降低
可以是由于離子色譜柱的柱效降低或選擇改變所引起的，可以通過適合的清洗對離子色譜柱進行清洗，或者改變離子色譜的流動相來改善分離。
3.死體積增大
由于分離柱入口樹脂壓力使樹脂造成空隙或才樹脂壓碎而成，使離子色譜分離度下降、分叉等，這時可以填充相同類型的樹脂和惰球樹脂球以減少死體積。
4.柱效下降
長時間在緩沖溶液中使用和進樣,將導致色譜柱離子交換能力下降,用稀酸緩沖溶液沖洗可以使陽離子柱再生,反之,用稀堿緩沖溶液沖洗可以使陰離子柱再生.另外,還可以選擇能溶解柱內污染物的溶劑為流動相做正方向和反方向沖洗.但再生后的色譜柱柱效是不可能恢復到新柱的水平的.如果柱子裝反了,可以調回來,但可能會造成柱內擔體塌陷.在不得已的情況下盡量不要反裝色譜柱。
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