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中草藥超聲波提取機主要有以下幾個作用：
1、機械攪拌。超聲的高頻振動及輻射壓力可在氣、液體中形成有效的攪動與流動。空化氣泡振動對固體表面產生的強烈射流及局部流，均能顯著減弱液體的表面張力及磨擦力，并破壞固-液界面的附面層，因而達到普通低頻機械攪動達不到的效果。這一作用是藥物透入，美容品導入皮膚，超聲除氣，食品及化妝品調勻細化等應用的物理基礎。
2、相互擴散。利用超聲振動及空化的壓力、高溫效應，促使兩種液體，兩種固體，或液-固、液-氣界面之間，發生分子的相互滲透，形成新的物質屬性。金屬或塑料的超聲焊接，超聲乳化、清洗、霧化可歸為此類作用。
3、均勻化。空化氣泡閉合后產生的局部沖擊波，可粉碎液體中的顆粒，使其細化；使結晶均勻；將較大、不均勻乳滴分散為微小均勻藥劑(如醫用造影劑、治癌藥劑等)；甚至可包括消溶血栓等作用。
4、凝聚作用。超聲振動可使氣、液媒質中懸浮粒子以不同速度運動，增加相碰撞機會；或利用駐波使它們趨于波腹處，從而發生凝聚過程。煙道收塵、人工降雨可屬此類。
5、機械切削作用。因超聲振動加速度甚大，加上空化的聲腐蝕作用，可對硬脆材料進行特形精密加工。
6、機械粉碎作用。利用高強度超聲脈沖，可以粉碎人體內的腎結石和膽結石而不損傷軟組織。
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