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為了獲得理想的實驗結果，必須根據實驗目的選擇適宜的觀察對象，在選擇動物時，需考慮如下因素：
種屬的選擇
不同種屬的動物對同一疾病病因刺激的反應程度會有很大的差異。在選擇實驗動物時，盡可能選擇對刺激因素較為敏感且與人類接近的種屬。例如在進行發熱實驗時，宜選家兔：在進行過敏反應和反應實驗時，宜選豚鼠；小鼠則宜用于半數致死量等方面的觀察。
性別的選擇
由于成年雌性動物的代謝存在著明顯的性周期的變化，這些變化會影響受試動物對某些實驗因素的反應狀態。因而在選擇實驗動物時，一般多用雄性動物，但熱板法鎮痛實驗不宜選用雄性小鼠或大鼠，半數致死量的測定應雌雄各半。
周齡或體重的選擇
一般選擇成年動物，小鼠體重18-22g，大鼠體重200-250g，豚鼠體重350-450g，家兔體重2.5-3.5kg，beagle犬體重8-20kg。但有些實驗對動物體重或周齡有特殊要求，如大鼠足腫脹法的抗炎實驗，宜選用120-150kg的大鼠，對致炎劑敏感。制作大鼠腦性低灌注模型時，宜選用13周齡以上的大鼠，可大大降低死亡率。
狀態的選擇
實驗動物對人類疾病的表達程度及對施加因素的反應情況，除了與動物自身的生理特征有關外，還受動物的狀態，如是否饑餓、睡眠是否足夠、是否患有其他疾病等的影響。因此，應選擇健康、反應機敏以及其它各個方面條件盡量一致的動物作為觀察對象。
實驗條件的選擇
由于環境因素對實驗結果有著很強的干擾作用，如明、暗(即光照周期)對體內代謝就有著重要的影響。在實驗時應選擇與受試動物自然生活盡量一致的實驗環境或人為地將實驗環境控制到符合條件的程度。
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