土壤養分速測儀對土壤養分測量準確性取決于土壤樣品的代表性。通常，取樣誤差會大于儀器測量誤差，為減少取樣誤差，必須增加取樣樹木以減少取樣誤差。土壤取樣數目太多容易增加土壤測量成本，土壤取樣樹木太少，土壤養分測量誤差加大，要想確定土壤樣品取樣數目就必須先了解不同因素對土壤取樣誤差影響。

不同用地類型的取樣誤差，土壤養分速測儀表明由于土壤利用方式不同,人類活動對土壤各種理化性狀的影響也不相同,勢必導致取樣誤差的變化。同取樣地塊之間,在相對距離為40的水平上,大致可分為3類,*類是池塘底泥它明顯不同于其它地塊;第二類似乎以各種地塊邊緣為主,研究原本取各種地塊邊緣作為人類活動對地塊理化參數分異的相對參照;第三類以各種耕地或用于種植業的地塊為主,各種類型相互交疊,難以劃分,故難反映出不同測定參數在不同土壤利用類型中各自的分布特點。

不同測定參數的取樣誤差，按照測定項目分類計算的平均相對標準偏差和各測定項目與取樣地塊面積的相關統計情況.土壤養分速測儀表明就不同地塊各測定項目而言,取樣誤差的大小是不同的大的可以達到150%以上,如S和Cl;小的還不到如pH和Cl,反映了土壤理化性狀參數分布的不均勻性本研究中,大部分測定參數的取樣誤差與面積無關,只有那些受成土母質影響較大、受環境擾動如施肥和耕作等因素影響較小的參數才與取樣面積呈顯著或極顯著相關。

土壤取樣誤差是土壤養分速測儀測量時土壤養分不可避免的，通過了解土壤養分取樣誤差影響因素，可以在提高土壤養分測量準確性。土壤取樣誤差研究表明,土壤取樣誤差與取樣點代表面積相關，同時人類活動對于土壤養分影響巨大，使得不同土壤養分種類差距巨大。