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熒光定量PCR儀可用于醫(yī)療，新藥研發(fā)，診斷檢驗試劑研發(fā)等領(lǐng)域。
在醫(yī)療方面，具體可用于病原體檢測；產(chǎn)前診斷以防止各類遺傳性疾病的發(fā)生；藥物療效考核，例如對乙型肝炎病毒 (HBV)、丙型肝炎病毒 (HCV) 定量分析顯示：病毒量與某些藥物的療效關(guān)系；腫瘤基因檢測。
在新藥開發(fā)研究中，實時熒光定量PCR技術(shù)可以快速、準確、定量、靈敏地測定血液或組織中病原體的含量，因此有利用分析藥物的作用效果，為比較不同的配方的療效、用藥量、用藥時間等等提供快速、定量的評價。
在新診斷及檢驗試劑的開發(fā)中，現(xiàn)有的很多診斷及檢驗方法都不能同時滿足快速、靈敏、定量的要求，而熒光定量PCR方法可以做到這一點，從而可為臨床疾病、商檢、糧油檢驗、食品檢驗、血液檢驗等等開發(fā)新的試劑，從而提高檢驗的靈敏度、速度及準確性等；這類試劑的種類是非常多的，所開發(fā)的試劑的社會效益及經(jīng)濟效益都是很巨大的。
由于熒光定量PCR方法的快速、靈敏、定量的特點，其在研究及開發(fā)方面的應(yīng)用是不勝枚舉的，如研究個人基因型與藥物療效之間的關(guān)系等；研究人員也可以根據(jù)自已研究項目開發(fā)其新的用途。
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