時空轉錄基因組學
時空轉錄基因組學(Spatially Resolved Transcriptomics, SRT)是近年來發展迅速的一個研究領域,它結合高分辨率的空間位置信息和轉錄組測序技術,以解析組織或細胞中基因表達的空間分布和時間變化。
時空轉錄基因組學作為一項前沿技術,在發育生物學、腫瘤研究、神經科學、免疫學研究、再生醫學、藥物研發、疾病模型構建等多個生物醫學領域展現出廣泛的應用潛力。
深圳華大生命科學研究院(以下簡稱華大研究院)作為時空轉錄基因組學領域的主要推動者之一,在2022年聯合多名科學家在《Cell》上發表了題為《Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball patterned arrays》的研究論文,結合 DNA 納米球 (DNB) 模式陣列和原位 RNA 捕獲來創建空間增強分辨率組學測序 (Stereo-seq)。應用Stereo-seq生成小鼠器官發生時空轉錄組圖譜(MOSTA),以單細胞分辨率和高靈敏度繪制了小鼠器官發生過程中轉錄變異的動力學和方向性。這一創新性的圖譜不僅深刻揭示了細胞間差異的分子根源,還清晰展現了大腦組織發育過程中的微妙變化,為探索遺傳性疾病的復雜發病機制提供強有力的工具。
麥克奧迪助力時空轉錄基因組學研究
值得一提的是,此次時空轉錄基因組學的研究專題成果,離不開高性能顯微鏡這一關鍵工具的助力——麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡。
麥克奧迪PA53掃描系列顯微鏡,為華大研究院的科研人員提供了洞察微觀世界的窗口。無論是生物樣本的精細結構解析,還是基因表達產物的直觀可視化,PA53掃描系列顯微鏡都能以優異的光學性能、精準的成像技術和人性化的操作設計,助力時空轉錄基因組學研究的深入發展。
麥克奧迪助力時空轉錄基因組學研究
PA53掃描系列是麥克奧迪光學公司自主研發設計的數字切片顯微鏡掃描平臺,它將傳統的玻璃切片進行掃描和無縫拼接,生成包括傳統玻璃切片內所有信息的全視野的數字化切片。目前,該系列顯微鏡被廣泛應用于生物樣品的觀察和分析、研究生物醫學材料與組織的相互作用、基因表達與檢測等領域,為科研和醫學診斷提供重要的手段和方法。
參考資料:
[1] Mengnan Cheng et al., Spatially resolved transcriptomics: a comprehensive review of their technological advances, applications, and challenges. Journal of Genetics and Genomics(2023).
[2] Ao Chen et al., Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball-patterned arrays. Cell (2022).
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