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羅氏實時熒光定量PCR儀(LightCycler®系統)工作原理

2025-6-10  閱讀(53)

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羅氏實時熒光定量PCR儀(LightCycler®系統)工作原理

實時熒光定量PCR(Quantitative PCR, qPCR)是一種結合PCR擴增和熒光檢測的技術,能夠對DNA或RNA進行精確定量。羅氏(Roche)的LightCycler®系列儀器(如LightCycler® 480)采用閉管檢測方式,通過監測PCR過程中熒光信號的變化,實現核酸的實時定量分析。其核心工作原理可分為以下幾個部分:


1. PCR擴增與熒光檢測的結合

實時熒光定量PCR在傳統PCR的基礎上引入熒光標記探針或染料,使擴增過程可以被實時監測。羅氏LightCycler®系統的主要檢測方式包括:

(1) 基于熒光探針的檢測(如TaqMan探針)

  • 探針結構

    • 探針兩端分別標記熒光報告基團(如FAM)淬滅基團(如TAMRA或BHQ)

    • 探針與目標DNA序列互補結合。

  • 工作原理

    • 在PCR延伸階段,Taq DNA酶發揮5'→3'外切酶活性,切割探針,使報告基團與淬滅基團分離。

    • 報告基團釋放熒光信號,其強度與PCR產物量成正比。

(2) 基于DNA結合染料的檢測(如SYBR Green)

  • 染料特性:SYBR Green可非特異性地結合雙鏈DNA,并在激發后發出熒光。

  • 檢測方式

    • 每輪PCR循環后,檢測熒光強度,反映雙鏈DNA的累積量。

    • 需配合熔解曲線分析(Melting Curve Analysis)驗證擴增特異性。


2. 光學檢測系統

羅氏LightCycler®儀器采用多通道熒光檢測,主要流程如下:

  1. 激發光源:LED或鹵素燈提供特定波長的激發光(如470nm、530nm等)。

  2. 熒光采集

    • 光學傳感器在每輪PCR循環后掃描各孔熒光信號。

    • 支持多重檢測(如FAM、HEX、ROX、Cy5等不同熒光通道)。

  3. 信號處理

    • 軟件記錄熒光強度變化,生成擴增曲線(Amplification Plot)。


3. 定量分析原理

(1) 閾值循環數(Ct值)

  • Ct值(Threshold Cycle):熒光信號達到設定閾值所需的PCR循環數。

  • 定量依據

    • 初始模板量越高,Ct值越??;反之,Ct值越大。

    • 通過標準曲線法(絕對定量)ΔΔCt法(相對定量)計算目標核酸濃度。

(2) 標準曲線法(絕對定量)

  1. 使用已知濃度的標準品(如質粒DNA)進行梯度稀釋并擴增。

  2. 繪制Ct值-log(起始拷貝數)標準曲線。

  3. 根據待測樣本的Ct值,計算其初始模板量。

(3) 熔解曲線分析(特異性驗證)

  • 適用情況:使用SYBR Green等非特異性染料時。

  • 原理

    • PCR結束后,緩慢升溫(如60°C→95°C),使雙鏈DNA解鏈。

    • 監測熒光信號隨溫度的變化,生成熔解曲線。

    • 單一峰表示特異性擴增;多峰提示引物二聚體或非特異性產物。


4. 羅氏LightCycler®系統的技術特點

  1. 快速溫控

    • 采用Peltier半導體技術,升降溫速率可達4.8°C/秒,縮短實驗時間。

  2. 多重檢測能力

    • 支持4–6色熒光通道,可同時檢測多個靶標(如病原體分型)。

  3. 閉管操作

    • 減少開蓋污染風險,提高檢測穩定性。


5. 應用示例

  • 病毒載量檢測(如HIV、HBV):通過Ct值定量病毒RNA/DNA。

  • 基因表達分析(qRT-PCR):比較不同樣本中mRNA的相對表達量。

  • 突變檢測:結合高分辨率熔解曲線(HRM)分析SNP或點突變。


6. 注意事項

  • 引物/探針設計:需確保特異性,避免交叉反應。

  • 防污染措施:使用UNG酶(尿嘧啶-DNA糖基化酶)降解殘留PCR產物。

  • 儀器校準:定期進行光學校準和溫度驗證,保證數據準確性。


總結

羅氏實時熒光定量PCR儀通過熒光標記探針或染料實時監測PCR擴增,結合多通道光學檢測Ct值分析,實現核酸的精確定量。其核心技術優勢在于快速溫控、多重檢測和閉管操作,適用于臨床診斷、科研及工業檢測等領域。實驗成功的關鍵在于優化反應體系、規范操作流程并定期維護儀器。


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