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中國科學院水生生物研究所（以下簡稱水生所）是從事內陸水體生命過程、生態(tài)環(huán)境保護與生物資源利用研究的綜合性學術研究機構，其前身是1930年1月在南京成立的國立中央研究院自然歷史博物館，1934年7月改名為中央研究院動植物研究所，1944年5月又分建成動物研究所和植物研究所。中國科學院成立以后，于1950年2月將國立中央研究院動物研究所、北平研究院動物學研究所、國立中央研究院植物研究所藻類部門合并，組建中國科學院水生生物研究所，所址上海，1954年9月遷至武漢。2011年水生所整體進入中國科學院“創(chuàng)新2020”試點工程。2015年被認定為中國科學院“*行動”計劃特色研究所。