當前位置:北京百泰派克生物科技有限公司>>檢測技術服務>>蛋白分析>> Edman降解的歷史、現狀與未來發展趨勢
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dànbáizhì的功能由其結構決定,而結構的基礎是一級序列。早在20世紀中葉,當人類尚未掌握測序DNA的能力時,蛋白測序已經開啟生命結構的探索旅程。而這一切的開端,離不開一個關鍵發明:Edman降解法。七十余年來,Edman降解見證了從人工手動操作到自動化分析的演進,也在質譜席卷蛋白組學時代后找到新的定位。本文將帶你回顧其技術演變,洞察它在當代研究中的角色,并探討其與未來蛋白結構研究的融合之路。
一、歷史溯源:從手工測序到自動化的技術飛躍
1、1950年:Pehr Edman 提出化學降解測序法
瑞典科學家Pehr Edman在1950年shǒucì描述了一種從N端逐步釋放并識別氨基酸殘基的方法,開創了蛋白測序的先河。其核心在于苯異硫氰酸(PITC)與N端氨基酸反應,形成可分離識別的PTH-AA衍生物。
2、1960-70年代:逐步實現自動化測序儀(Sequenator)
通過與高效液相色譜(HPLC)聯用,Edman降解實現了循環自動化測序,可測定多達30個氨基酸的序列,精度和重現性大幅提升。
3、1990年代起:質譜興起,Edman降解退居“驗證工具"
隨著ESI與MALDI等軟電離質譜技術的普及,質譜測序(尤其是de novo分析)在效率、通量、修飾識別能力上全面超越Edman法。后者逐漸轉向小規模驗證用途,尤其擅長識別N端序列、蛋白標簽、信號肽等精細結構。
二、從主角轉向“jīngzhǔn補刀"的結構驗證工具
1、Edman降解仍被廣泛應用于以下場景:
(1)蛋白N端驗證與起始位點確認
→ 檢測表達蛋白是否包含預期標簽、信號肽是否被剪切
(2)抗體或融合蛋白構建驗證
→ 檢測Fab、Fc區域是否拼接正確
(3)翻譯后修飾屏蔽的序列解析
→ 在某些N端修飾較輕或易逆反應樣品中,仍可獲得準確結果
(4)支持質譜測序結果驗證
→ 在新序列/無參考數據庫情境中,提供輔助驗證維度
2、仍需注意的技術限制:
在百泰派克生物科技,我們將Edman測序與高分辨率質譜整合,打造適合藥物研發需求的“蛋白結構確證+標簽驗證"一體化解決方案。
三、未來趨勢:Edman降解的智能化、整合化發展路徑
1、與質譜聯用,實現雙平臺互補
現代蛋白測序趨勢是:jīngzhǔn+高通量+多修飾識別并重。Edman降解無法單獨滿足這些要求,但可作為:
* De novo測序結果的N端驗證工具
質譜識別結果中的翻譯起始位點補強手段
高通量篩查后的關鍵序列確認技術
2、儀器自動化與微量測序的結合
新一代自動Edman降解儀搭載微流控芯片技術,使得樣品用量從微克級降至納克級,大幅擴展其適用范圍。未來或可拓展至:
* 單細胞表達產物驗證
高通量表達克隆庫篩選
3、AI輔助序列解析與整合分析平臺構建
AI算法正在參與dànbáizhì結構預測與數據整合。若將Edman測序數據、質譜碎片譜圖與AlphaFold預測序列協同分析,將為復雜蛋白變異解析帶來更高精度的輔助工具。
盡管Edman降解不再是主流蛋白測序技術,但其在jīngzhǔn、低背景、高特異性識別N端序列方面仍具有bùkětìdài的地位。在抗體藥、疫苗、生物類似藥等新一代藥物研發中,Edman降解作為質譜的有力補充,正煥發新的技術生命力。憑借zhuānyè的技術團隊和7大質量控制檢測平臺,百泰派克生物科技為從事dànbáizhì組學研究的科研人員提供高質量Edman降解分析服務,獲得廣泛認可。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優勢:
1.采用目前世界上先進的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析,發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高,實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統準確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢:
1.技術先進,填補技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務,幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系,zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務;
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等;
4.七大質量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業,10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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