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產(chǎn)品型號(hào)
品 牌百泰派克
廠商性質(zhì)其他
所 在 地北京市
更新時(shí)間:2025-06-09 14:55:58瀏覽次數(shù):32次
聯(lián)系我時(shí),請(qǐng)告知來(lái)自 化工儀器網(wǎng)DIA-MS蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)如何賦能多組學(xué)整
翻譯后修飾蛋白質(zhì)組學(xué)在癌癥研究中的應(yīng)用:
BioID 與 APEX檢測(cè)技術(shù)服務(wù)
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引言:jīngzhǔn識(shí)別N端序列,為蛋白研究打下基礎(chǔ)
在dànbáizhì研究中,氨基酸序列的jīngquè鑒定是理解其功能與結(jié)構(gòu)的dìyī步。雖然現(xiàn)代質(zhì)譜技術(shù)已在dànbáizhì組學(xué)領(lǐng)域大放異彩,但在某些特定場(chǎng)景下,一種經(jīng)典的序列分析方法依然bùkěhuòquē——Edman降解(Edman degradation)。這種以化學(xué)方式從N-端逐步解析dànbáizhì序列的技術(shù),因其高特異性和準(zhǔn)確度,至今仍廣泛應(yīng)用于蛋白表達(dá)驗(yàn)證、N端修飾檢測(cè)、質(zhì)量控制等多個(gè)關(guān)鍵領(lǐng)域。作為dànbáizhì測(cè)序服務(wù)的重要組成部分,Edman降解為科研人員提供了一種低偏差、高保真度的Nduāncèxù手段。在百泰派克生物科技,我們結(jié)合自動(dòng)化Edman測(cè)序平臺(tái)與高質(zhì)量純化流程,為客戶提供jīngzhǔn可靠的N端序列解析解決方案,助力基礎(chǔ)研究與生物制藥開發(fā)。
一、什么是Edman降解?
Edman降解是一種基于化學(xué)反應(yīng)的順序性Nduāncèxù方法,由Pehr Edman于1950年提出。其核心原理在于使用苯異硫氰酸(PITC)與dànbáizhìN端的游離氨基反應(yīng),形成一種可切割的衍生物,隨后經(jīng)酸水解釋放出dìyī個(gè)氨基酸殘基并進(jìn)行鑒定。此過程可在保留剩余肽鏈完整性的前提下循環(huán)進(jìn)行,從而一步步解碼dànbáizhì的N端序列。
Edman反應(yīng)的三步核心流程:
1、PITC標(biāo)記:在堿性條件下,PITC與肽鏈N端氨基結(jié)合,形成苯異硫氰酸酰胺。
2、酸解釋放:加入無(wú)水酸催化斷裂,使N端氨基酸以可識(shí)別的形式(PTH-AA)釋放。
3、序列循環(huán):殘余肽鏈再次進(jìn)入下一輪循環(huán),重復(fù)上述步驟。
目前,市面上已發(fā)展出多種自動(dòng)化Edman測(cè)序儀,使得該技術(shù)可對(duì)純化蛋白樣本進(jìn)行高達(dá)30個(gè)氨基酸殘基的順序解析,具有良好的重復(fù)性與穩(wěn)定性。
二、Edman降解的優(yōu)勢(shì)與局限性
盡管質(zhì)譜技術(shù)的興起為dànbáizhì組學(xué)打開了新天地,但Edman降解依然以其化學(xué)反應(yīng)的確定性和序列位點(diǎn)的準(zhǔn)確性在多個(gè)關(guān)鍵場(chǎng)景下保有一席之地。
1、優(yōu)勢(shì):
(1)高度特異性:僅對(duì)N端游離氨基起反應(yīng),避免其他位點(diǎn)干擾。
(2)序列位置確定:每次循環(huán)均從N端開始,序列定位準(zhǔn)確。
(3)適用于蛋白表達(dá)驗(yàn)證:可與理論序列比對(duì),確認(rèn)表達(dá)產(chǎn)物正確性。
(4)檢測(cè)翻譯后修飾:能直接判斷N端是否有乙酰化、甲酰化等封閉修飾。
2、局限性:
(1)樣本要求高:必須為純化蛋白,N端不能被封閉或修飾。
(2)測(cè)序長(zhǎng)度有限:一般zuì多測(cè)定20~30個(gè)氨基酸。
(3)通量較低:不適用于復(fù)雜混合物或高通量分析。
因此,在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)階段,研究人員需權(quán)衡不同測(cè)序技術(shù)的適用性,以獲得zuì具信息價(jià)值的數(shù)據(jù)。
三、Edman測(cè)序在現(xiàn)代dànbáizhì研究中的應(yīng)用
1、生物藥開發(fā)與質(zhì)量控制
在重組蛋白藥物的生產(chǎn)中,N端序列是藥品一致性、穩(wěn)定性和正確表達(dá)的重要指標(biāo)。Edman測(cè)序可用于:
* 驗(yàn)證表達(dá)產(chǎn)物的N端氨基酸與設(shè)計(jì)序列是否一致
檢測(cè)信號(hào)肽是否成功切除
監(jiān)控不同批次之間的表達(dá)一致性
2、翻譯起始位點(diǎn)驗(yàn)證
在構(gòu)建表達(dá)載體時(shí),研究人員往往關(guān)心是否從預(yù)期的起始密碼子開始翻譯。Edman降解通過直接讀取N端序列,可jīngzhǔn驗(yàn)證翻譯起始位點(diǎn)是否偏移。
3、蛋白N端修飾分析
某些蛋白可能經(jīng)歷N端乙酰化、甲酰化、胺甲酰化等修飾。當(dāng)Edman降解無(wú)法進(jìn)行時(shí),反而說(shuō)明存在封閉修飾,提示需進(jìn)一步使用質(zhì)譜進(jìn)行結(jié)構(gòu)確認(rèn),從而構(gòu)建完整的N端修飾圖譜。
四、Edman測(cè)序與質(zhì)譜:互補(bǔ)而非替代
在現(xiàn)代dànbáizhì組學(xué)中,Edman測(cè)序與質(zhì)譜并非競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系,而是優(yōu)勢(shì)互補(bǔ)。質(zhì)譜具有高通量、廣覆蓋的優(yōu)勢(shì),可快速掃描復(fù)雜樣本;而Edman降解則以其jīngzhǔn、低背景、序列位置明確的特點(diǎn),為重點(diǎn)蛋白提供jīngzhǔn確認(rèn)。
常見的組合策略包括:
1、先質(zhì)譜、后Edman:初篩蛋白后,對(duì)關(guān)鍵條帶進(jìn)行Edman驗(yàn)證
2、Edman篩選修飾蛋白,再上LC-MS/MS定位修飾位點(diǎn)
3、抗體驗(yàn)證中同時(shí)使用質(zhì)譜和Edman,確保N端一致性
百泰派克生物科技的Nduāncèxù服務(wù)優(yōu)勢(shì)
在百泰派克生物科技,我們深知Nduāncèxù在科研和生物制藥開發(fā)中的重要性。為此,我們搭建了自動(dòng)化Edman測(cè)序平臺(tái),配套完善的純化、定量和質(zhì)量控制體系,為客戶提供一站式N端序列分析服務(wù)。
我們的優(yōu)勢(shì)包括:
高靈敏度設(shè)備:搭載優(yōu)良PPSQ-51A測(cè)序儀,zuì少可識(shí)別1~5 pmol蛋白樣本
純化支持服務(wù):提供SDS-PAGE條帶回收、PVDF膜轉(zhuǎn)印等前處理方案
多輪循環(huán)控制:zuì長(zhǎng)可達(dá)30個(gè)氨基酸殘基,準(zhǔn)確還原N端結(jié)構(gòu)
詳盡報(bào)告交付:包括原始圖譜、電泳圖片、序列比對(duì)和技術(shù)說(shuō)明
在如今強(qiáng)調(diào)“jīngzhǔn測(cè)序、全鏈驗(yàn)證"的時(shí)代背景下,Edman降解并未被淘汰,反而在多種新型生物制品開發(fā)中再次“回歸主場(chǎng)"。Edman降解測(cè)序依然憑借其化學(xué)解析的確定性和N端分析的特異性,在dànbáizhì研究領(lǐng)域保持dútè價(jià)值。它不僅是質(zhì)譜技術(shù)的重要補(bǔ)充,更在某些關(guān)鍵應(yīng)用場(chǎng)景中發(fā)揮著bùkětìdài的作用。百泰派克生物科技提供zhuānyè的基于Edman降解的蛋白N端序列分析服務(wù),可解決您的項(xiàng)目問題,加速您的研究項(xiàng)目,為您帶來(lái)優(yōu)質(zhì)的服務(wù)體驗(yàn)。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;
4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);
6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢(shì):
1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);
2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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