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在抗體藥物的研發(fā)過程中,dànbáizhì序列的準確解析是確保藥物功能與安全性的核心環(huán)節(jié)。然而,抗體分子N末端的化學修飾或結構異常(即“N末端阻斷")常導致傳統測序技術失效,這一問題已成為抗體開發(fā)領域長期存在的技術瓶頸。Edman降解作為一種經典的Nduāncèxù方法,憑借其dútè的化學特性,在應對這一挑戰(zhàn)中展現出bùkětìdài的價值。本文將深入探討N末端阻斷的成因及其對抗體開發(fā)的影響,并解析Edman降解技術如何突破這一困境。
一、抗體開發(fā)中的N末端阻斷難題
1、N末端阻斷的生物學基礎
抗體分子的N末端區(qū)域是抗原結合位點(CDR區(qū))的重要組成部分,其結構完整性直接決定抗體的特異性與親和力。然而,在重組表達或儲存過程中,N末端可能發(fā)生多種不可預測的化學修飾:例如jiǎliúānsuān殘基的氧化、氨基甲酰化反應,或是宿主細胞酶系導致的非預期剪切。這些修飾不僅改變dànbáizhì的理化性質,更會掩蓋N末端的游離氨基,導致基于氨基反應的測序技術無法啟動。
2、技術挑戰(zhàn)的雙重性
N末端阻斷帶來的影響具有雙重性:一方面,阻斷位點阻礙了常規(guī)質譜分析中對肽段N端的識別,導致序列覆蓋率出現關鍵缺口;另一方面,在抗體工程化改造中,若無法確認N端修飾類型,將難以設計有效的突變體進行功能優(yōu)化。更棘手的是,某些修飾(如環(huán)化反應)可能形成穩(wěn)定的共價結構,常規(guī)的還原烷基化處理難以有效逆轉。
二、Edman降解的技術原理與dútè優(yōu)勢
Edman降解是一種經典而可靠的dànbáizhìN端順序測定技術。由Pehr Edman在20世紀40年代提出,它基于化學方法對多肽鏈N端的氨基酸逐一識別,過程溫和、選擇性強,是zuì早實現自動化蛋白測序的技術。其基本原理是:利用苯異硫氰酸酯(PITC)與N端氨基發(fā)生專一反應,在堿性環(huán)境下形成PITC衍生物,繼而通過酸水解切斷dìyī個氨基酸,并將其轉化為穩(wěn)定的酰基異硫氨酸(PTH)形式,再經高效液相色譜(HPLC)分析確認氨基酸種類。此過程循環(huán)進行,每輪脫去一個氨基酸,逐步獲得完整N端序列。
Edman降解在應對N端阻斷時具備以下幾個突出的優(yōu)勢:
高度特異的N端識別機制,可判斷N端是否真實暴露;
對小范圍修飾具備一定容忍度,可通過預處理手段“解封"部分封閉結構;
無需復雜的數據庫或假設序列支持,避免質譜中“猜測式"匹配誤差;
適用于高純度抗體的驗證分析,尤其是在質譜信號不理想的區(qū)域補充信息。
三、在抗體開發(fā)流程中的應用場景
在現代抗體藥物開發(fā)流程中,從序列設計、表達構建,到功能篩選和生產放大,序列信息始終處于核心地位。Edman降解在以下關鍵節(jié)點中展現出dútè價值:
1、抗體序列確認階段
在構建表達載體或篩選抗體片段庫時,研究人員需確保所選序列與目標序列一致。尤其在單克隆抗體篩選中,部分抗體可能在表達后其N端被修飾或丟失。利用Edman降解可快速確認N端起始氨基酸,防止因錯配引起的親和力變化或結構不穩(wěn)定。
2、工藝開發(fā)中的質量控制
抗體在大規(guī)模表達中可能由于宿主細胞酶活、培養(yǎng)條件或純化步驟引發(fā)N端結構變化。若依賴質譜分析無法確認N端位點,極易遺漏批次差異。Edman降解可作為關鍵點位的驗證手段,強化質量監(jiān)控體系。
3、法規(guī)審評與申報支持
藥品監(jiān)管機構對生物藥要求jígāo的一致性證明。若N端區(qū)域存在不確定性,將影響整個序列完整性聲明。Edman降解可以在法規(guī)申報材料中作為結構確認的補強證據,提高產品研發(fā)透明度與可信度。
4、抗體改造與新構型評估
在抗體人源化、Fc工程或構建融合抗體(如scFv、BiTE)時,N端多被改造。Edman降解可協助研發(fā)人員jīngquè掌握融合區(qū)的表達情況,避免功能域遮蔽或空間構象異常。
Edman降解,雖然歷經多年技術發(fā)展與替代浪潮,仍在解決具體科研與應用難題中展現出dúyǒu價值。尤其是在N末端阻斷這樣的“隱性障礙"前,它提供了jīngzhǔn、高效、可靠的解決路徑。回歸實驗本源、擁抱技術多樣性,正是當前dànbáizhì組學領域實現突破的必要路徑。而Edman降解,正是這一路徑中被低估卻bùkěhuòquē的一環(huán)。百泰派克生物科技提供zhuānyè的基于Edman降解的蛋白N端序列分析服務,可解決您的項目問題,加速您的研究項目,為您帶來優(yōu)質的服務體驗。
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
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6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。
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百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質量譜,zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
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1.技術優(yōu)良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右,而流式質譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現了數量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
百泰派克基于高分辨率質譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析,到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證,建立了完備的質量體系,數據冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。
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