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美國Bd 單細胞分析系統 Rhapsody TM
產品介紹
當對序列讀取進行計數時,PCR擴增偏差可導致基因定量不準確。BD的分子標簽技術為單個細胞的單個基因分配了的分子索引,也稱為“分子條形碼"。實驗者可借此克服擴增偏差,更準確地計算轉錄水平。
系統組件包括
。BD Rhapsody 掃描儀
。BD Rhapsody 上樣臺
。BD Rhapsody 卡片芯片
。分子標簽試劑和文庫制備
。特定應用的靶向檢測試劑盒(pancl)
為您的實驗定制工作流程
對于不同用戶和實驗,單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質量和通量。BD儀器選項可以根據具體需求進行配置。BD FACS分選機(如BD FACSMelody )是BD Rhapsody系統上游樣本富集的良好選擇。BD Rhapsody掃描儀提供自動化細胞計數和細胞樣本活性測試,幫助用戶制備適用于卡式芯片單細胞捕獲的濃度的樣本。掃描儀提供了卡式芯片上微球捕獲細胞的計數。BD Rhapsody上樣臺輕巧便攜,可在實驗室內輕松移動。同樣還提供生物信息學途徑和可視化工具。這些工具包括UMI分析算法和可視化工具,即使沒有經驗的用戶也可分析和理解單細胞數據。
數千個單細胞數百個基因的平行分析
單線胞RNAscq正在改變我們對細胞的理爭。BD Rhapsody TM 單細胞分析系弘基于BD在細胞生物學領域40年的專業技術,滿足您的實驗需求,在單細胞水平理解細胞形態和功能。
這種全新的分析系統克服了傳統檢測的局限性,例如,微陣列和大量細胞RNAscq,這些檢測通過實驗對各個細胞之間的微妙差異的觀察,依賴于對多個細胞的平均檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細胞類型。其進一步幫助理解從免疫學到腫瘤學等各個領域內的生物學過程。
BD Rhapsody 單細胞分析系統能對成千上萬個單細胞的數百個基因進行數字定量,提供足夠靈活的定制測定法以滿足任何實驗需要,其有效系統可縮短實驗時間和降低測序成本。
使單細胞測序效率更高
靶向方法對單細胞分析的益處通過使用競爭產品的WTA測定和BD Rhapsody免疫反應組合(panel)(人)在相似的測序深度下對外周血單核細胞(PBMC)進行表達譜分析來證明。雖然兩種測定方法的t-SNE表達譜分析都顯示了已知PMBC細胞類型的聚類結果,靶向組合(panel)顯示了比WTA更高的靈敏度(讀數/細胞)和UMI計數效率。BD Rhapsody測定實現了與競品WTA測定類似的聚類性能,而測序讀數降低了近10倍(靶向讀數2k vs. WTA讀數20k)。與使用WTA方法不同,靶向組合(panel)避免了對多個高表達基因的測序如核糖體蛋白或低表達變異性,從而提高測定效率。
更有效的測序可以更低的成本實現更高的通量
由于與高通量實驗方法相關的測序成本,單細胞實驗往往非常昂貴。BD Rhapsody單細胞分析系統設計有多個功能,可以更有效地利用測序來降低實驗成本。
· 靶向測定-由于檢測靈敏度的提高,特定的基因組合方法可使用少量的時間和成本,幫助產生類似于全轉錄組分析(Whole Transcriptome Analysis,WTA)測定的結果。這種方法還提高了UMI計數效率,從而極大程度的節省了實驗時間和成本。
· 儲存-從樣本中得到的完整cDNA可在磁性微球上穩定存儲,允許將珍貴樣本保存長達16周。這可使用戶在時間允許的情況下靈活地對樣本進行測序,并通過對儲存的微球池進行等分或分樣來實現同一樣本的多個測定。
· 分樣—在磁性微球上儲存的cDNA A可以分成一個或多個等分試樣,并使用定制或預先設計的組合(panel)進行擴增。通過提供對部分樣本進行測序的選項和對樣本不同組合(panel)進行測試的靈活性,分樣可降低成本。
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