供水：飲用水是傳染病的主要傳播媒介。據調查，農村地區50%的傳染病是由飲用水污染造成的。臭氧在我國被廣泛用于滅菌和去除水中的重金屬，是目前常用的滅菌劑。無致癌物氯鹵化，無二次污染。

游泳水：消毒效果好，消毒快。臭氧氣體對常見大腸桿菌的殺滅速度比氯氣快幾百倍，對病毒和原核生物有很好的殺滅效果。臭氧氣體可以防止有機污染物的積累，改善水質，脫色和殺滅病原微生物，處理后的水可以有效防止傳染病的傳播。在保證游泳者健康的情況下，臭氧可以有效減少水中的污染物，減少副產物氯（一氯胺、三氯胺、三氯烷烴等的產生）。池內殘留的臭氧在處理過程中不會超過安全限值，還能對空氣進行滅菌凈化，使室內空氣清新舒適。

工業用水的消毒：在水處理中，臭氧是一種強氧化劑，可以氧化水中的各種雜質，達到凈化水質的目的。同時，臭氧也是一種非常有效的消毒劑，可以快速效率高地殺滅細菌和病毒，不會造成二次污染。