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熒光定量PCR( realtime fluorescence quantitative PCR,RTFQ PCR)是通過熒光染料或熒光標記的特異性的探針,對PCR產物進行標記跟蹤,實時在線監控反應過程,結合相應的軟件可以對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。可用于mRNA、microRNA、lncRNA等基因表達量的檢測。
熒光定量Q-PCR原理:
熒光定量PCR常有兩種檢測方法
1)探針法
PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標記一個報告熒光基團和一個淬滅熒光基團。探針完整時,報告基團發射的熒光信號被淬滅基團吸收;剛開始時, 探針結合在DNA任意一條單鏈上;PCR擴增時,Taq酶的5’端-3’端外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監測系統可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現了熒光信號的累積與PCR產物形成*同步。
2)熒光定量Q-PCR檢測染料嵌入法
使用熒光染料SYBR或EVGreen。熒光染料可以結合到雙鏈DNA上面,當體系中的模板被擴增時,熒光染料可以有效結合到新合成的雙鏈上面,隨著PCR的進行,結合的熒光染料越來越多,被儀器檢測到的熒光信號越來越強,從而達到定量的目的。
熒光定量Q-PCR檢測實驗方法:
1)引物設計
2)RNA提取
3)RNA逆轉錄合成cDNA
4)real time PCR 反應
5)數據分析
熒光定量Q-PCR檢測實驗結果
基因表達量變化的直方圖、熱圖等
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