上海單細(xì)胞分離是在單細(xì)胞研究中使用廣泛的技術(shù)，其高出其他方法幾個(gè)數(shù)量級(jí)的篩選能力和富集細(xì)胞的特性讓前面提到的技術(shù)*。

   上海單細(xì)胞分離在基礎(chǔ)研究和臨床中的使用已經(jīng)成熟。但是，由于對(duì)已知免疫特征的依賴，它無法被用來篩選特征未知的異質(zhì)細(xì)胞，而單細(xì)胞研究的主旨就是發(fā)現(xiàn)未知，這導(dǎo)致其在生物探索領(lǐng)域的功用存在缺憾。另一方面，上海單細(xì)胞分離的優(yōu)勢(shì)是富集具有同質(zhì)免疫特性的細(xì)胞，但產(chǎn)物仍然是許多細(xì)胞的懸浮液，將其應(yīng)用于單細(xì)胞分選需要比較繁瑣的改進(jìn)，且仍然缺乏簡(jiǎn)便有效的驗(yàn)證方法，對(duì)此目前還沒有商業(yè)化解決方案。

   對(duì)單細(xì)胞的研究在上世紀(jì)初就已經(jīng)開展，當(dāng)時(shí)的技術(shù)水平只允許在顯微鏡下用口吸式毛細(xì)管收集單個(gè)細(xì)胞。顯微操作技術(shù)的應(yīng)用隨后改變了這種局面，精密設(shè)備解放了研究人員的口和手，使得這一過程更加安全、可靠和易控。然而，用這種方式獲取細(xì)胞的效率仍然低下，一次操作通常只以獲取少量單細(xì)胞為目的，而且過程可 控性低不易重復(fù)。因此，該方法更適用于顯微注射而不是單細(xì)胞研究。

   相比其他需要分解組織以獲取游離細(xì)胞的技術(shù)，激光顯微切割有著*的*性，該方法利用激光束切割組織切片，因此可以在獲得單細(xì)胞的同時(shí)保存其在組 織中的空間位置信息，但其劣勢(shì)也同樣明顯。細(xì)胞形態(tài)不規(guī)則，損失細(xì)胞質(zhì)甚至是細(xì)胞核或是切入相鄰細(xì)胞的情況時(shí)有發(fā)生。另外，在多數(shù)情況下細(xì)胞因?yàn)槔鋬龌虬裉幚?，在獲取的同時(shí)已經(jīng)死亡。 

   基于磁珠的單細(xì)胞分離純化方法也被開發(fā)出來，其原理也是基于抗體對(duì)細(xì)胞免疫特征的識(shí)別，但實(shí)驗(yàn)要求低，操作相對(duì)方便，對(duì)細(xì)胞的刺激也較小，其短板在于它只能實(shí)現(xiàn)正選和反選，即選擇帶有某種標(biāo)記或不帶標(biāo)記的細(xì)胞，無法利用多通道設(shè)計(jì)更加精細(xì)的篩選方案。

   上海單細(xì)胞分離技術(shù)雖然近得到不少關(guān)注， 開展相關(guān)實(shí)驗(yàn)的門檻卻是人們不得不正視的一個(gè)問題，對(duì)大量單細(xì)胞進(jìn)行單獨(dú)測(cè)序文庫制備的需求與高昂的測(cè)序費(fèi)用之間的矛盾一直是讓不少人感興趣的話題。僅僅是試劑的消耗就可以很快上升到讓人難以承受的程度。因此，利用微流控芯片分離并制備單細(xì)胞測(cè)序文庫的方案很快就得到了廣泛的關(guān)注。

   上海單細(xì)胞分離不僅大幅降低了實(shí)驗(yàn)成本，還使單個(gè)細(xì)胞內(nèi)及其的模板濃縮，提高了實(shí)驗(yàn)的靈敏度和效率。此外，相關(guān)技術(shù)高度集成化和自動(dòng)化，能滿足同時(shí)處理大量單細(xì)胞的需求。