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EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒:快速高效的研究體內(nèi)DNA-蛋白質(zhì)相互作用

時間:2024/12/16閱讀:86
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在體內(nèi)富集組蛋白或轉(zhuǎn)錄因子(TF)復(fù)合DNA,然后進行qPCR/或下一代測序,為研究全基因組蛋白質(zhì)-DNA相互作用提供了有利的工具。通常用于實現(xiàn)這一目標(biāo)的主要方法是染色質(zhì)免疫沉淀,然后進行測序(ChIP-seq)。該方法包括高度特異的ChIP-exoChIP-nexus。這兩種分析提供了高分辨率的繪圖。然而,這些檢測的主要局限性在于,它們需要大量的輸入材料、細(xì)胞或組織才能在背景噪聲中產(chǎn)生足夠強的信號。CUT&RUN(靶下切割和核酸酶下釋放)是為繪制蛋白質(zhì)與DNA與有限生物材料的相互作用而開發(fā)的,這需要更少的樣品量,也顯著提高了繪制分辨率。然而,該測定的一個相當(dāng)大的缺點是抗體未偶聯(lián)的pAG-MNase的非特異性切割,顯著限制了CUTRUN對不同物種和細(xì)胞/組織類型中大多數(shù)轉(zhuǎn)錄因子的特異性。此外,原始的CUT&RUN步驟復(fù)雜,需要優(yōu)化測定條件,這仍然很耗時。

 

艾美捷EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒

貨號:P-2035-24

輸入類型:細(xì)胞、組織

研究領(lǐng)域:染色質(zhì)與轉(zhuǎn)錄

目標(biāo)應(yīng)用:蛋白質(zhì)-DNA富集

容器格式:管

 保證:6個月

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒組成:

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*使用前將溶液旋轉(zhuǎn)到底部。

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒檢測原理:

EpiNext™ CUT&LUNCH(目標(biāo)下切割并均勻釋放D特核酸復(fù)合物)試劑盒提供了一種快速高效的方法來研究體內(nèi)DNA-蛋白質(zhì)相互作用。它整合了ChIPCUT&RUN的所有優(yōu)勢,同時有效解決了它們的局限性。

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒具有以下優(yōu)點和特點:

極快速的三步協(xié)議:直接從完整的細(xì)胞開始,無需ConA固定。程序可以在1小時50分鐘內(nèi)完成,最小化核損傷和染色質(zhì)損失,同時保持天然染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。

增強的特異性和最小化的背景:D特的核酸切割酶通過選擇性地在目標(biāo)蛋白/DNA復(fù)合物兩端切割DNA,確保低序列偏差,不影響與蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA。非特異性蛋白-DNA復(fù)合物被選擇性消除,實現(xiàn)目標(biāo)蛋白富集區(qū)域的高分辨率映射。

低輸入材料:在最短時間內(nèi)完成強大的未結(jié)合DNA切割和免疫捕獲。這種方法同時使用細(xì)胞和組織,同時提供目標(biāo)蛋白的最大降解保護和最小樣本損失。因此,輸入的細(xì)胞數(shù)量可以少至500個細(xì)胞。

廣泛的適用性:適用于各種物種的培養(yǎng)細(xì)胞以及新鮮或冷凍組織,與組蛋白和轉(zhuǎn)錄因子兼容,同時保持檢測的特異性和靈敏度。

高度便捷:試劑盒包含所有必要的組分,使EpiNext™ CUT&LUNCH檢測試劑盒既方便又經(jīng)濟。

與現(xiàn)有流程的無縫集成:用于NGS的富集DNA可以與現(xiàn)有的、經(jīng)過時間考驗的ChIP-seq生物信息學(xué)軟件和工具一起分析。

 

EpiNext CUT&LUNCH檢測試劑盒保存建議

該試劑盒分兩部分運輸:第一部分在室溫下,第二部分在4°C的冷凍冰袋上。

收到后,根據(jù)上表中的溫度避光儲存組件。

注:使用前檢查WB(清洗緩沖液)和PB(透化緩沖液)是否含有鹽沉淀。 如果是這樣,請在室溫或37°C下短暫加熱并搖晃,直至鹽重新溶解。

試劑盒的所有組分在適當(dāng)儲存的情況下,自裝運之日起可穩(wěn)定儲存6個月

 

 

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