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不適宜的培養和保藏條件是加速菌種衰退的另一個重要原因。不良的培養條件如營養成分、溫度、濕度、pH值、通氣量等和保藏條件如營養、含水量、溫度、氧氣等，不僅會誘發衰退型細胞的出現，還會促進衰退細胞迅速繁殖，在數量上大大超過正常細胞，造成菌種衰退。

大腸埃希氏菌    Escherichia coli
大腸埃希氏菌    Escherichia coli
黑曲霉    AspergillusnigervanTieghem
茄鏈格孢（番茄早疫病菌）    Alternaria solani
茄鏈格孢（番茄早疫病菌）    Alternaria solani
辣椒疫霉    Phytophthora capsici
辣椒疫霉    Phytophthora capsici
尖鐮孢黃瓜專化型（黃瓜枯萎病菌）    Fusarium oxysporum f. sp. cucumerinum
痢疾志賀氏菌    Shigella dysenteriae
支氣管炎博德特氏菌    Bordela bronchissptica
扭脫甲基桿菌    Methylobacterium extorquens
桃色擬青霉    Paecilomyces persicinus
米曲霉    Aspergillus oryzae
黃曲霉    Aspergillus flavus
隆紋黑蛋巢菌    Cyathus striatus (Huds.) Willd.
球孢白僵菌    Beauveria bassiana
尖鐮孢西瓜專化型(西瓜枯萎病菌)    Fusarium oxysporium f. sp.
產黃青霉    PenicilliumchrysogenumThom
白假絲酵母    凍干物
大腸埃希氏菌    凍干物
金黃色葡萄球菌    凍干物
綠膿假單胞菌（銅綠假單胞菌)    凍干物
層出鐮孢    Fusarium proliferatum
肺炎鏈球菌    Pectobacterium atrosepticum (van Hall) Gard ..
金黃色葡萄球菌金黃亞種    Staphylococcus aureus subsp.aureus
吸水鏈霉菌    Streptomyceshygroscopicus(Jensen)WaksmanetHe ..