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DNA快速脫保護(hù)劑儀器使用方案討論

閱讀:2062        發(fā)布時(shí)間:2019-6-20

全自動(dòng)寡核苷酸合成的脫保護(hù)步驟對(duì)合成時(shí)間和產(chǎn)品質(zhì)量非常重要。為了提高合成速度、純度和產(chǎn)率,我們經(jīng)常使用如下幾種快速脫保護(hù)試劑。
 
1. 用dC(ac)代替dC(bz) —— Beckman 認(rèn)證方法
Acetyl-protected phosphoramidtes的特征:

  • 超速脫保護(hù)(65℃時(shí)10 min)
  • 寡核苷酸合成中是關(guān)鍵成分
  • 工業(yè)標(biāo)準(zhǔn)
  • 使用AMA方法時(shí)不變化
  • 純度與操作非常相關(guān)
  • 在認(rèn)證的ISO 9001質(zhì)量系統(tǒng)下操作

 2. TAC試劑
在溫和條件下,用含TAC保護(hù)基代替標(biāo)準(zhǔn)保護(hù)基可使脫保護(hù)反應(yīng)加速(在溫和條件下),適用于含有base-labile單體的寡核苷酸。
 
TAC的特征:

  • TAC基團(tuán)的脫保護(hù)速度很快,在有濃氨條件下,55℃ 15min或在室溫中2 h。
  • 與AMA脫保護(hù)試劑兼容(AMA是一個(gè)混合物,含有大于25%的氨溶液和40%的jia胺)
  • 在乙腈中易溶。不需要加入混合溶劑,如二甲基甲酰胺或二氯甲烷。
  • 適用于含有活潑基的低聚體合成,如燃料和修飾物。
  • DNA合成中不變化是必要的條件,除快速脫保護(hù)試劑Cap A代替Cap A。
  • 應(yīng)用dA(tac)可以提高寡核苷酸的質(zhì)量.

3. dG(dmf)方法
改變二甲基jia胺(dmf)dG的保護(hù)基可以加速合成高純度、高產(chǎn)率的寡核苷酸。因此也提高了高通量的產(chǎn)量。
 
dG的特征

  • dG(dmf)脫保護(hù)的速度比傳統(tǒng)dG(ib)快,在濃氨中脫保護(hù)的時(shí)間是55℃ 2 h,65℃ 1 h。
  • dG (dmf)-單體適用于G多的序列;與傳統(tǒng)的dG(ib)比較,未脫保護(hù)率被極大地降低了。
  • dG (dmf)-amidite在溶液中與dA(bz)、dC(bz)、dT一樣穩(wěn)定。
  • dG(dmf)amidite可以直接替代dG (ib)-amidite
  • 在DNA合成中沒(méi)有改變是必須的條件,除有低濃度的iocline oxidizer,如0.02 Miocline, 存在。

4. 替代dC保護(hù)基
改變TAC  dC的保護(hù)基可以加速合成高純度、高產(chǎn)率的寡核苷酸。用dC (tac)代替dC (bz)可以加快AMA脫保護(hù)的速度,提供高通量寡核苷酸的合成。
 
dC的特征

  • 用AMA脫保護(hù)可以加速,*脫保護(hù)需要10 min,在65℃條件下。
  • C-單體的副反應(yīng)通過(guò)轉(zhuǎn)氨作用被消除。
  • 對(duì)一些修飾過(guò)的核苷酸都可用。
  • dC (tac)-amidite可以直接替代dC (bz)-amidite。
  • 用乙腈溶解amidite, DNA合成不改變。在標(biāo)準(zhǔn)醋酐的capping試劑中可以用。

DNA快速脫保護(hù)基反應(yīng)器是為有效制備生物樣品而設(shè)計(jì)的,用于PCR引物、探針和組分生產(chǎn),DNA測(cè)序、DNA和RNA合成、隨機(jī)啟動(dòng)、載體設(shè)計(jì)、DNA指紋和人工基因合成。是DNA/RNA/寡核苷酸脫保護(hù)基快捷穩(wěn)定的解決方案。反應(yīng)可直接在96位樣品架上進(jìn)行,如“深井”板。6-10個(gè)樣品架可用于10升壓力反應(yīng)器。因此,操作工作量大大縮短。樣品被填充不同的板,例如帶有過(guò)濾底座、特殊蓋等,通過(guò)設(shè)計(jì)的電動(dòng)升降系統(tǒng),在反應(yīng)中和反應(yīng)后自動(dòng)移出壓力容器進(jìn)行干燥。在開(kāi)啟和關(guān)閉過(guò)程中,會(huì)抽走腐蝕性反應(yīng)氣體,確保實(shí)驗(yàn)室人員的*安全。與樣品的反應(yīng)發(fā)生在氣相的壓力和微波效應(yīng)下。高氣相濃度會(huì)在幾分鐘內(nèi)引起*均勻的反應(yīng)。在系統(tǒng)中,所有操作參數(shù)均一直根據(jù)程序條件進(jìn)行控制,并以圖形方式記錄和存儲(chǔ)以進(jìn)行質(zhì)量控制。在整個(gè)過(guò)程中,液體試劑以及氣相中的壓力和溫度是被控制的。這確保了樣品的完整、可重復(fù)和均勻反應(yīng),以便隨后分離出選擇性DNA序列。*的10升反應(yīng)器容量為*的樣品吞吐量提供了新的可能性。

 

DNA快速脫保護(hù)基反應(yīng)器應(yīng)用:

 

食品工業(yè)

研究機(jī)構(gòu)

大學(xué)

分子生物學(xué)

遺傳學(xué)

合成生物學(xué)

醫(yī)學(xué)

 

寡核苷酸脫保護(hù)基微波高壓反應(yīng)器特點(diǎn):

反應(yīng)器容量:10升容量

樣品數(shù)量:6至10個(gè),每個(gè)樣品有96位。

溫度范圍:*200°C

功率輸出:1200瓦

符合CE標(biāo)志

保修12個(gè)月

電源:220 V至240 V/50/60 Hz

*功耗:2500瓦

顯示屏:彩色觸摸屏

尺寸:W x D x H 52 x 73 x 123厘米(無(wú)終端)

重量:180公斤

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