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定量和定性分析。
凝膠成像系統采用數碼相機或高分辨率CCD攝影將攝取的圖像直接輸入計算機系統。在暗箱中的光源燈照射下，通過調節變焦光圈、變焦倍數及焦距使清晰及大小合適。圖像社區獲得后，通過軟件中圖像處理菜單進行調整和圖像優化。以降低圖像本底噪聲。一般經過這樣處理后能得到清晰的凝膠圖片。
凝膠成像系統可以對樣品進行定量和定性分析。
凝膠成像分析系統進行定量和定性分析的原理是：光源發出的光照射樣品，不同的樣品對光源吸收的量有差異。光密度與樣品濃度或者質量成線性關系，將未知樣品的光密度與已知濃度的樣品皮帶的光密度進行比較，可以得到未知樣品的濃度或者質量，做定量分析。
凝膠成像分析系統定性分析的原理是：由于樣品在電泳凝膠或者其他載體上的遷移率不一樣，將未知樣品在圖譜中的位置與標準品在圖譜中的位置相比較，可以確定未知樣品的成分和性質，做定性分析。

凝膠成像光源分為四種，分別是透射紫外，反射紫外，透射白光，反射白光。

　　①透射紫外：可激發多種熒光染料。光源波長302nm或365nm。

　　②反射紫外：紫外反射燈源使用并不廣泛，主要是提供非透明材質的DNA跑膠載體如紙層析等的成像需要而使用。由于比較常用的還是透明的瓊脂糖凝膠與聚丙烯酰胺凝膠，透射光源*可以滿足，因此凝膠成像中通常將紫外反射光源作為選配件不列入標配中。光源波長254nm或365nm。