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色譜分析 - 氨基酸特點

2019-6-26  閱讀(748)

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氨基酸既有酸性又有堿性,意味著它既包含酸性基團(羧酸),又包含堿性基團(伯胺)。
但這些基團通過肽鍵與殘基縮合。
多個氨基酸通過肽鍵連接形成肽鏈。
蛋白質/多肽的特征由氨基酸側鏈決定。
本文包含詳細描述和功能概述。
包括氨基酸的名稱、三字母縮寫和單字母符號。

 

氨基酸

特性

結構

丙氨酸

Ala

      A

類型:疏水性

功能:側鏈由疏水性甲基組成。與其它疏水性氨基酸一樣,丙氨酸協助形成并維持蛋白質的三級結構。

精氨酸

Arg

      R

類型:堿性
功能:精氨酸側鏈有三個緊密結合的氮原子,是一種堿性*的氨基酸,pH高達12.5。
      精氨酸與天冬氨酸或谷氨酸形成靜電復合物(鹽橋),強化蛋白質的三級結構。
      它還與附著在蛋白質的酸性基團相互作用,例如核酸的磷酸基團。

天冬酰胺 

Asn

N

類型:弱極性
功能:天冬酰胺是脫酰胺的主要位置,也是甘氨酸(低聚糖)的結合點。

天冬氨酸

Asp

      D

類型:酸性

功能:天冬氨酸的pH4,與堿性氨基酸相互作用形成靜電復合物(鹽橋)。
      天冬氨酸還是金屬離子等帶正電荷基團的結合位點,其功能的發揮在多種蛋白質中很重要。

半胱氨酸

Cys

      C

類型:弱極性(含硫)

功能:半胱氨酸在蛋白質的三級結構中具有重要作用,其與其它半胱氨酸側鏈發生反應并在多肽鏈的不同部分形成共價鍵(二硫鍵)。

谷氨酰胺

Gln

      Q

類型:弱極性

功能:谷氨酰胺的脫酰胺作用與天冬酰胺相比較難,因此基本不作為脫酰胺位點。

谷氨酸

Glu

      E

類型:酸性

功能:谷氨酸的pH稍高于4,與堿性氨基酸相互作用形成靜電復合物(鹽橋)。
      谷氨酸還是金屬離子等帶正電荷基團的結合位點,其功能的發揮在多種蛋白質中很重要。

甘氨酸

Gly

      G

類型:中性
功能:甘氨酸非常小,側鏈僅有一個氫,它作為中性氨基酸在肽鏈中延伸。

組氨酸

His

      H

類型:堿性
功能:組氨酸側鏈為弱堿性,pH6~7之間。組氨酸能夠與酸結合,但取決于環境pH。

異亮氨酸

Ile

       I

類型:疏水性
功能:與其它疏水性氨基酸一樣,異亮氨酸殘基協助形成并維持蛋白質的三級結構。

亮氨酸

Leu

       L

類型:疏水性
功能:與其它疏水性氨基酸一樣,亮氨酸協助形成并維持蛋白質的三級結構。

賴氨酸

Lys

      K

類型:堿性
功能:賴氨酸側鏈是伯胺類,pH~10.5。
      賴氨酸與天冬氨酸或谷氨酸形成靜電復合物(鹽橋),強化蛋白質的三級結構。
      它還與附著在蛋白質的酸性基團相互作用,例如核酸的磷酸基團。

甲硫氨酸

Met

     M

類型:弱疏水性(含硫)

功能:甲硫氨酸是可能被氧化的氨基酸。它是發生氧化作用的指示劑。甲硫氨酸氧化還可能影響生物活性。

苯丙氨酸

Phe

F

類型:疏水性、芳香性
功能:與其它疏水性氨基酸一樣,苯丙氨酸協助形成并維持蛋白質的三級結構。
       由于具有芳香性,苯丙氨酸還是紫外光吸收的有效檢測目標。

脯氨酸

Pro

      P

類型:弱疏水性
功能:脯氨酸是一種*的氨基酸,其疏水側鏈與氨基酸末端連接,在肽鏈中產生張力,使肽鏈彎曲。
      該結構特征協助形成蛋白質的三級結構。

絲氨酸

Ser

      S

類型:極性(含羥基)
功能:絲氨酸通過氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質結合。還能通過氫鍵與其它蛋白質或基團結合。
      絲氨酸還是細胞蛋白質磷酸化的位點。

蘇氨酸

Thr

       T

類型:極性(含羥基)

功能:蘇氨酸通過氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質結合。還能通過氫鍵與其它蛋白質或基團結合。
       蘇氨酸還是細胞蛋白質磷酸化的位點。

酪氨酸

Tyr

      Y    

類型:極性(含羥基)、芳香性

功能:酪氨酸通過氫鍵與其它氨基酸殘基或部分蛋白質結合。還能通過氫鍵與其它蛋白質或基團結合。
      酪氨酸還是細胞蛋白質磷酸化的位點。酪氨酸具有芳香性,提供紫外吸收位點。


色氨酸

Trp

     W

類型:疏水性、芳香性
功能:色氨酸具備多環結構,能夠通過氫鍵延長。由于具備芳香性,色氨酸提供紫外光吸收位點。
       色氨酸還能發出微弱的天然熒光。


 

 

 

 

 

 

纈氨酸

Val

      V

類型:疏水性
功能:纈氨酸側鏈是一個疏水性異丙基。
      與其它疏水性氨基酸一樣,纈氨酸協助形成并維持蛋白質的三級結構。

 

各個氨基酸的豐度
疏水性氨基酸在蛋白質三級結構的形成中起到關鍵作用,通常位于蛋白質的核心區。
它們約占蛋白質中氨基酸的50%。
極性氨基酸具有很多重要的結構性或功能性作用,豐度一般較高。
豐度低的氨基酸包括甲硫氨酸、組氨酸、半胱氨酸及色氨酸。

 

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