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a. 清洗與再生
如果發生峰形改變、峰分叉、出現肩峰、保留時間改變、分離度變化或柱壓升高，說明色譜柱可能已被污染。通常情況下，用純有機溶劑進行沖洗（小心避免緩沖液出現沉淀）就足以去除污染物。如果沖洗不能解決問題，可采用以下清洗和再生步驟灌注色譜柱。請根據樣品和/或您認為污染色譜柱的物質的性質，選擇與之匹配的常規清洗方法（見表3）。用20倍柱體積（例如對于4.6×250 mm色譜柱，使用80 mL溶劑）HPLC級溶劑沖洗色譜柱。將流動相溫度升至35℃~55℃可以提高清潔效率。
表3：色譜柱清洗溶劑使用順序和其他選項
保護柱需要根據樣品污染情況定期更換。當系統背壓穩步上升至設定壓力限值時，通常表明需要更換保護柱。突然出現分叉峰也表明需要更換保護柱。
b. 存放
為了盡可能延長色譜柱壽命和提高性能，使用色譜柱之后請用100％乙腈保存保存色譜柱。請勿使用含緩沖液或鹽的水性流動相保存色譜柱。如果流動相洗脫液中含有酸/堿性添加劑、緩沖液或鹽，請先用至少10倍柱體積（常用色譜柱的柱體積見表1）HPLC級水沖洗色譜柱，再用至少15倍柱體積HPLC級100%乙腈沖洗色譜柱，然后再儲存。如果不執行這些步驟，可能導致緩沖鹽在色譜柱內沉淀。使用隨附的端塞完全密封色譜柱，防止溶劑蒸發導致柱床變干。
注：如果色譜柱運行了含甲酸鹽（如甲酸銨、甲酸等）的流動相，并且之后使用100%乙腈進行沖洗，那么在重新安裝色譜柱并再次運行含甲酸鹽的流動相時，柱平衡花費的時間可能略長。
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