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轉染效率低?小翊手把手教你做轉染實驗
細胞膜是由磷脂雙分子層和鑲嵌蛋白組成的,帶有負電荷。因此帶有負電荷的DNA或RNA無法通過細胞膜。為了讓核酸(DNA或RNA)通過細胞膜,研究人員利用不同的方法,包括使用化學物質和包被核酸的載體分子進行中和,以及在細胞膜上開孔等物理方法,將核酸(DNA或RNA)直接運輸到細胞內。這些就是轉染的過程,轉染的目的是促進蛋白合成,調節基因表達,促進細胞生長與發育等,目前越來越多地被用到功能研究中。
圖1 DNA/RNA轉染過程(圖片來源:圖片來源于網絡)
1.常見轉染方法
根據導入的核酸在目的細胞中存活時間的長短,可以將轉染技術分為瞬時轉染和穩定轉染。也可以根據轉染方式的不同,分為化學轉染,物理轉染、和生物轉染方法。例如脂質體轉染、陽離子聚合物PEI轉染、電轉、顯微注射、以及慢病毒包裝轉染等等。
但是,沒有一種轉染試劑可以滿足所有的實驗要求。必須根據您的細胞類型(原代細胞、貼壁細胞、懸浮細胞)、外源核酸種類(DNA、RNA)、基因表達時間、細胞毒性、轉染效率等,操作是否簡便等因素,挑選出///理想的轉染試劑。
圖2不同轉染方法的原理和優點
在轉染過程中,即使選對了合適的轉染試劑,還是不可避免會出現各種令人頭疼的問題,例如,轉染效率低,細胞死亡,重復性差等問題。對于這些問題,我們接下來會詳細剖析。
2.轉染效率低
2.1轉染前
1)核酸純度不夠,比如DNA/RNA不純、質粒中含有內毒素、核酸不完整、核酸濃度過低均會導致轉染效率低。建議使用高純度的DNA或RNA有助于獲得較高的轉染效率。
2)要檢測所用的無血清培養基與轉染試劑的相容性,已知CD293, SFMII, VP-SFM 與轉染試劑不相容。
3)用了含有血清的培養基制備轉染復合物。血清會降低復合物的形成。建議用無血清培養基稀釋DNA/RNA和轉染試劑。
4)DNA或RNA的復合物形成的比例,一般DNA(µg):轉染試劑(µL)=1:2~1:3;而RNA(ng):轉染試劑(µL)=9:1~3:1。
5)復合物孵育時間過短,未能充分形成復合物。建議復合物孵育時間10~20 min。
6)轉染試劑保存不當,降低轉染效率。保存在4 ºC冰箱,不可凍存,避免反復長時間開蓋。
2.2轉染時
7)細胞密度過低或過高。DNA轉染細胞密度90%~95%,RNA轉染細胞密度30%~50%。
8)細胞生長狀態不佳。清除支原體、真菌、細菌等污染,保證提供新鮮的生長培養基。
9)轉染時細胞上清液中含有抗生素、生長因子等,大大降低轉染效率。
2.3轉染后
10) 轉染時間過短。一般質粒表達水平在24~48h,mRNA表達水平在24~72 h,蛋白表達水平在48~96 h。
3.細胞毒性大
3.1轉染前
1)核酸純度不純也會造成細胞毒性。要確保質粒中無內毒素,使用高純度的DNA或RNA會降低細胞毒性。
2)轉染試劑過量。優化轉染試劑的用量,以及優化復合物的比例。
3)要檢查稀釋復合物的培養基與細胞的相容性,已知DMEM培養基對一些昆蟲細胞系有毒性。建議選擇合適的培養基。
3.2轉染時
4)細胞密度過低,會導致部分細胞死亡。DNA轉染細胞密度90%~95%,RNA轉染細胞密度30%-50%。
5)細胞生長狀態不佳。清除支原體、真菌、細菌等污染,保證提供新鮮的生長培養基。
3.3轉染后
6)轉染后目的蛋白的過度表達對細胞產生毒性。建議及時更換新鮮培養基,或者添加一些營養物質。
7)轉染后表達蛋白對細胞產生毒性。建議換一種細胞系重新轉染。
8)轉染時間過短,就進行抗性篩選。一般質粒表達水平在24~48h,mRNA表達水平在24~72 h,蛋白表達水平在48~96 h。
9)抗性篩選時,加入的抗生素濃度過高。適當降低抗生素的濃度。
4.重復性差
4.1轉染前
1)移液誤差。將DNA/RNA和轉染試劑充分打勻后,用移液器緩慢均勻的吸取,避免產生誤差。
2)制備復合物時,未充分混勻。將DNA/RNA和轉染試劑輕輕混勻,并保證相同的孵育時間。
4.2轉染時
3)細胞密度存在差異。一般在特定的密度范圍內,細胞密度越低,轉染效率越低,相反越高。
4)細胞生長狀態存在差異。好的細胞狀態,轉染效率越高。
5)細胞傳代次數不同。對于多次傳代的細胞,細胞的基因組和表型都會發生變化,不建議使用傳代次數過多的細胞進行轉染實驗。
4.3轉染后
6)轉染時間不一致,表達的蛋白水平會有差異。
5.相關文獻及產品
已發表文章
[1] Chen T, Chen Y, Chen H, et al. Dual-enzyme-propelled unbounded DNA walking nanomachine for intracellular imaging of lowly expressed microRNA[J]. Nano Research, 2019, 12(5): 1055-1060. (IF 8.21)
[2] Zhang X, Qi Z, Yin H, et al. Interaction between p53 and Ras signaling controls cisplatin resistance via HDAC4-and HIF-1α-mediated regulation of apoptosis and autophagy[J]. Theranostics, 2019, 9(4): 1096. (IF 8.12)
[3] Zhang K, Zhao X, et al. Enhanced Therapeutic Effects of Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes with an Injectable Hydrogel for Hindlimb Ischemia Treatment. ACS Appl Mater Interfaces. 2018 Sep 12;10(36):30081-30091.(IF 8.09)
[4] Chen Y, Hao Q, Wang J, et al. Ubiquitin ligase TRIM71 suppresses ovarian tumorigenesis by degrading mutant p53[J]. Cell Death and Disease, 2019, 10(10): 1-14. (IF 5.72)
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