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轉染效率低?小翊手把手教你做轉染實驗

2020-9-28  閱讀(571)

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轉染效率低?小翊手把手教你做轉染實驗

細胞膜是由磷脂雙分子層和鑲嵌蛋白組成的,帶有負電荷。因此帶有負電荷的DNARNA無法通過細胞膜。為了讓核酸DNARNA通過細胞膜,研究人員利用不同的方法,包括使用化學物質和包被核酸的載體分子進行中和,以及在細胞膜上開孔等物理方法,將核酸(DNARNA直接運輸到細胞內這些就是轉染的過程,轉染的目的是促進蛋白合成,調節基因表達,促進細胞生長與發育等,目前越來越多地被用到功能研究中。

 

圖1 DNA/RNA轉染過程(圖片來源:圖片來源于網絡)

1.常見轉染方法

根據導入的核酸在目的細胞中存活時間的長短,可以將轉染技術分為瞬時轉染和穩定轉染。也可以根據轉染方式的不同,分為化學轉染,物理轉染、和生物轉染方法。例如脂質體轉染、陽離子聚合物PEI轉染、電轉、顯微注射、以及慢病毒包裝轉染等等。

但是,沒有一種轉染試劑可以滿足所有的實驗要求。必須根據您的細胞類型(原代細胞、貼壁細胞、懸浮細胞)、外源核酸種類(DNA、RNA)、基因表達時間、細胞毒性、轉染效率等,操作是否簡便等因素,挑選出///理想的轉染試劑。

 

 圖2不同轉染方法的原理和優點

在轉染過程中,即使選對了合適的轉染試劑,還是不可避免會出現各種令人頭疼的問題,例如,轉染效率低,細胞死亡,重復性差等問題。對于這些問題,我們接下來會詳細剖析。

 

2.轉染效率低

 

2.1轉染前

1)核酸純度不夠,比如DNA/RNA不純、質粒中含有內毒素、核酸不完整、核酸濃度過低均會導致轉染效率低。建議使用高純度的DNA或RNA有助于獲得較高的轉染效率。

2)要檢測所用的無血清培養基與轉染試劑的相容性,已知CD293, SFMII, VP-SFM 與轉染試劑不相容。

3用了含有血清的培養基制備轉染復合物血清會降低復合物的形成建議用無血清培養基稀釋DNA/RNA和轉染試劑

4)DNA或RNA的復合物形成的比例,一般DNA(µg):轉染試劑(µL)=1:2~1:3;而RNA(ng):轉染試劑(µL)=9:1~3:1。

5復合物孵育時間過短,未能充分形成復合物。建議復合物孵育時間10~20 min。

6)轉染試劑保存不當,降低轉染效率。保存在4 ºC冰箱,不可凍存,避免反復長時間開蓋。

2.2轉染時

7)細胞密度過低或過高。DNA轉染細胞密度90%~95%,RNA轉染細胞密度30%~50%。

8)細胞生長狀態不佳。清除支原體、真菌、細菌等污染,保證提供新鮮的生長培養基。

9)轉染時細胞上清液中含有抗生素、生長因子等,大大降低轉染效率。

2.3轉染后

10) 轉染時間過短。一般質粒表達水平在24~48h,mRNA表達水平在24~72 h,蛋白表達水平在48~96 h。

3.細胞毒性大

 

3.1轉染前

1)核酸純度不純也會造成細胞毒性。要確保質粒中無內毒素,使用高純度的DNA或RNA會降低細胞毒性。

2)轉染試劑過量。優化轉染試劑的用量,以及優化復合物的比例。

3)要檢查稀釋復合物的培養基與細胞的相容性,已知DMEM培養基對一些昆蟲細胞系有毒性。建議選擇合適的培養基。

3.2轉染時

4)細胞密度過低,會導致部分細胞死亡。DNA轉染細胞密度90%~95%,RNA轉染細胞密度30%-50%。

5)細胞生長狀態不佳。清除支原體、真菌、細菌等污染,保證提供新鮮的生長培養基。

3.3轉染后

6)轉染后目的蛋白的過度表達對細胞產生毒性。建議及時更換新鮮培養基,或者添加一些營養物質。

7)轉染后表達蛋白對細胞產生毒性。建議換一種細胞系重新轉染。

8)轉染時間過短,就進行抗性篩選。一般質粒表達水平在24~48h,mRNA表達水平在24~72 h,蛋白表達水平在48~96 h。

9)抗性篩選時,加入的抗生素濃度過高。適當降低抗生素的濃度。

4.重復性差

 

4.1轉染前

1)移液誤差。將DNA/RNA和轉染試劑充分打勻后,用移液器緩慢均勻的吸取,避免產生誤差。

2)制備復合物時,未充分混勻。將DNA/RNA和轉染試劑輕輕混勻,并保證相同的孵育時間。

4.2轉染時

3)細胞密度存在差異。一般在特定的密度范圍內,細胞密度越低,轉染效率越低,相反越高。

4)細胞生長狀態存在差異。好的細胞狀態,轉染效率越高。

5)細胞傳代次數不同。對于多次傳代的細胞,細胞的基因組和表型都會發生變化,不建議使用傳代次數過多的細胞進行轉染實驗。

4.3轉染后

6)轉染時間不一致,表達的蛋白水平會有差異。

5.相關文獻及產品

已發表文章

[1] Chen T, Chen Y, Chen H, et al. Dual-enzyme-propelled unbounded DNA walking nanomachine for intracellular imaging of lowly expressed microRNA[J]. Nano Research, 2019, 12(5): 1055-1060. (IF 8.21)

[2] Zhang X, Qi Z, Yin H, et al. Interaction between p53 and Ras signaling controls cisplatin resistance via HDAC4-and HIF-1α-mediated regulation of apoptosis and autophagy[J]. Theranostics, 2019, 9(4): 1096.  (IF 8.12)

[3] Zhang K, Zhao X, et al. Enhanced Therapeutic Effects of Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes with an Injectable Hydrogel for Hindlimb Ischemia Treatment. ACS Appl Mater Interfaces. 2018 Sep 12;10(36):30081-30091.(IF 8.09)

[4] Chen Y, Hao Q, Wang J, et al. Ubiquitin ligase TRIM71 suppresses ovarian tumorigenesis by degrading mutant p53[J]. Cell Death and Disease, 2019, 10(10): 1-14. (IF 5.72)

 

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