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Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit

2020-9-23  閱讀(335)

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產(chǎn)品信息
 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品編號

規(guī)格

價格(元)

Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit

11355ES25

25 T

3465

11355ES50

50 T

6455

11355ES60

100 T

9945


產(chǎn)品描述
 

CRISPR/Cas9是一種由RNA指導(dǎo)Cas核酸酶對靶向基因進(jìn)行特定DNA修飾的技術(shù),源于細(xì)菌和古細(xì)菌為應(yīng)對噬菌體和外源質(zhì)粒的攻擊而演化來的一種獲得性免疫防御機制。在現(xiàn)代生物技術(shù)研究中,此系統(tǒng)是通過人工優(yōu)化的具有引導(dǎo)作用的sgRNA(Single Guide RNA)引導(dǎo)核酸酶Cas9蛋白在與sgRNA配對的靶位點處剪切雙鏈DNA,從而引起DNA斷裂。由于生物體內(nèi)非同源末端修復(fù)機制或同源重組機制修復(fù)DNA,導(dǎo)致基因移碼突變、替換或刪除,致使基因功能喪失。

Hifair® Precision sgRNA Synthesis Kit采用T7 RNA聚合酶混合物高效轉(zhuǎn)錄spCas9 sgRNA。本試劑盒含有能被Cas9蛋白識別并起支架作用的特異性序列,該序列的一部分能與使用者設(shè)計的目標(biāo)特異序列部分重疊。退火形成互補鏈后由DNA聚合酶進(jìn)行填充。終生成用于轉(zhuǎn)錄的dsDNA模板。本試劑盒利用其提供的試劑和使用者自己設(shè)計的特異性DNA序列,單管反應(yīng)可在4小時內(nèi)獲得20-100μg具有功能的sgRNA。


產(chǎn)品組分
 

編號

組分

產(chǎn)品編號/規(guī)格

11355ES25 (25 T)

11355ES50 (50 T)

11355ES60 (100 T)

11355-A

10×sgRNA Enzyme Mix

50 μL

100 μL

200 μL

11355-B

10×sgRNA Reaction Buffer

50 μL

100 μL

200 μL

11355-C

2×Canace Enzyme Mix

312.5 μL

625 μL

1.25 mL

11355-D

Scaffold Template

31.25 μL

62.5 μL

125 μL

11355-E

NTPs(25mM each)

200 μL

400 μL

800 μL

11355-F

Control sgRNA Oligo(10μM)

10 μL

20 μL

40 μL


運輸儲存方法
 

干冰運輸。-20℃保存,有效期兩年。


注意事項
 

1. 反應(yīng)體系中須嚴(yán)格注意不要混入RNase。

2. 實驗器材(如:槍頭、產(chǎn)品管等)注意嚴(yán)格使用 RNase Free用品。

3. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。

 

合成原理

1600753268611612.png
 


操作流程
 

1. 上游引物(Target-specific sgRNA oligo)設(shè)計

A. 引物的5’端:T7啟動子序列加保護堿基(20nt:TTCTAATACGACTCACTATA)

B. 轉(zhuǎn)錄起始位點:添加0~2個G,添加G的個數(shù)由靶序列的5’端決定,T7啟動子至少需要2個G才能有效轉(zhuǎn)錄。

(注:若特異靶序列已經(jīng)存在2個G,則不需要額外添加,額外的G會降低剪切效率。)

C. 特異的sgRNA靶序列(20nt):靶DNA序列PAM(NGG)的5’端20nt堿基序列。

D. 引物的3’端:Scaffold Template退火序列(14nt:GTTTTAGAGCTAGA)。

示例: 

DNA模板:

 圖片.png

上游引物(Target-specific sgRNA oligo):

 

 

圖片.png

2. sgRNA合成

A.sgRNA模板擴增

①按下列體系配制反應(yīng)體系:

組分

體積(μL)

終濃度

RNase free H2O

Up to 25

-

Scaffold Template

1.25

-

sgRNA Oligo(10μM)

1.25

0.5μM

2×Canace Enzyme Mix

12.5

注: 1. Scaffold Template已預(yù)先與下游引物混合

     2. 使用試劑、容器等無RNase污染。

②PCR反應(yīng)程序:

循環(huán)步驟

溫度

時間

循環(huán)數(shù)

變性

98℃

10s

30

延伸

68℃

10s

保持

4℃

 

③電泳檢測:

使用2%瓊脂糖膠,取5μL PCR反應(yīng)液電泳檢測條帶大小及亮度,用100bp DNA Ladder(貨號:10507)標(biāo)定,其大小為120bp左右單一條帶。

B.體外轉(zhuǎn)錄sgRNA

①按下列體系室溫配制反應(yīng)體系:

組分

體積(μL)

終濃度

RNase free H2O

Up to 20

-

10×sgRNA Reaction Buffer

2

NTPs (25 mM each)

8

10 mM each

sgRNA模板(上述A獲得)

5

-

10×sgRNA Enzyme Mix

2

注: 1. 低溫配置可能引起DNA模板沉淀。

     2. 使用試劑、容器等無RNase污染。

②反應(yīng)程序:

溫度

時間

37℃

4h

4℃

注:反應(yīng)于PCR儀中進(jìn)行,熱蓋打開,防止長時間導(dǎo)致反應(yīng)液蒸發(fā)。

DNA模板消化:

反應(yīng)完成后,每管加入2μL DNaseⅠ(RNase free),37℃孵育15min以去除模板DNA。

④轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物純化:

體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物可選用 RNA Cleaner 磁珠進(jìn)行純化(貨號:12602),也可以采用酚/氯坊純化法(具體操作步驟可聯(lián)系Yeasen索取),以去除蛋白、游離的核苷酸等

HB200916

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