聯(lián)系電話(huà)
北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司
中級(jí)會(huì)員·11年
- 聯(lián)系人：
- 譚柳
- 電話(huà)：
- 010-62210403
- 手機(jī)：
- 13146220038
- 傳真：
- 86-010-89756821
- 地址：
- 北京昌平區(qū)北七家鎮(zhèn)東沙工業(yè)園384號(hào)
- 個(gè)性化：
- www.dingguocs.com
- 手機(jī)站：
- m.dingguocs.com
- 網(wǎng)址：
- www.dingguocs.com
掃一掃訪(fǎng)問(wèn)手機(jī)商鋪
宏基因組學(xué)測(cè)序的主要瓶頸是快速有效的DNA提取。我們對(duì)多種樣本類(lèi)型采用了三種磁珠提取法平臺(tái)(KingFisher, epMotion, and Tecan)和一種標(biāo)準(zhǔn)化離心柱法平臺(tái)進(jìn)行了DNA提取效率的比較實(shí)驗(yàn)，這些樣本包括糞便、口腔、皮膚、土壤和水。美國(guó)科學(xué)家Clarisse Marotz等提取重復(fù)樣本并且用16S rRNA基因擴(kuò)增平行測(cè)序來(lái)評(píng)估提取差異和DNA質(zhì)量。數(shù)據(jù)證明，與樣本的多樣性相比，提取方法對(duì)測(cè)序結(jié)果的任何影響很小。然而，KingFisher平臺(tái)可以在zui短的時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生zui大量的高質(zhì)量讀長(zhǎng)序列。基于這些結(jié)果，我們?cè)跊](méi)有丟失細(xì)菌分類(lèi)或豐度信息的情況下顯著減少了樣本的處理時(shí)間。
原文：
DNA extraction for streamlined metagenomics of diverse environmental samples. Clarisse Marotz, Amnon Amir, Greg Humphrey. BioTechniques 62:290-293 (June 2017).
