（一）像素與灰度
1．像素 是構(gòu)成顯示器圖像的zui基本單元，按行和列（X和Y）方向排列成矩列。任何一矩列均對應(yīng)一個點(diǎn)，這些點(diǎn)稱為像素。單位面積屏幕上像素愈多則圖像愈清晰，即分辨率愈高，顯示的圖像也越細(xì)膩和真實(shí)。數(shù)字圖像的像素越多，灰度量化等級也越多，圖像分析儀分析出的結(jié)果越準(zhǔn)確。但是。當(dāng)像素達(dá)到一定量時，由于圖像分析儀計算機(jī)的存儲量和計算量呈幾何級數(shù)增大，從而減慢了計算機(jī)的處理速度。
2．灰度 系指圖像每一像素的明暗（深淺）程度，即該像素的圖像由黑到白變化的量化等級。顯微圖像分析系統(tǒng)的灰度量化等級均為2n，較常見的為28，即256個量化等級。灰度的量化等級越多，圖像分析系統(tǒng)的灰度分辨率越高，顯示出的圖像明暗層次越豐富。越接近被攝圖像的真實(shí)顏色的明暗（深淺）層次。灰度值的大小與物質(zhì)含量多少呈反比關(guān)系，灰度值越小，表示染色越深，所含物質(zhì)的量越多（0代表黑色，2n—1代表白色）。一般人眼能分辨的灰度級僅為15～25，計算機(jī)在灰度的分辨能力上要強(qiáng)于人眼，因此，當(dāng)人眼用顯微鏡觀察得出無明顯差別時，用圖像分析系統(tǒng)則可能反映出兩者的顯著差異。

（二）色彩
依據(jù)圖像的顏色可分為黑白圖像與彩色圖像，后者又可再分為偽彩色圖像與真彩色圖像。黑白圖像沒有色彩信息，偽彩色圖像僅僅是根據(jù)灰度值人為地設(shè)定為不同的顏色，以便于進(jìn)一步分析。真彩色圖像是由圖像采集裝置將每一像素的真實(shí)色彩分解為紅、綠、藍(lán)三種原色信號，每種原色信號又有其灰度等級，zui終再通過計算機(jī)重新編碼還原為彩色圖像。所以，真彩色圖像所包含的信息量多于前兩者。

（三）光密度
光密度又稱吸光度，是指光線通過某一物質(zhì)前與通過后光強(qiáng)度（Io與Ib）比值的對數(shù)值，即log（Io／Ib）。光密度值與物質(zhì)含量成正比關(guān)系，光密度值越小，說明光線被吸收的程度越小，物質(zhì)含量則越低。

（四）長度
對于形狀不規(guī)則的線形組織結(jié)構(gòu)，一般方法很難計算出長度，如組織中的毛細(xì)血管和神經(jīng)纖維，細(xì)胞超微結(jié)構(gòu)中的各種膜性結(jié)構(gòu)等，以往常用排列稀疏或密集等詞描述，圖像分析儀則可測出各種圖像周界線的長度。例如：在活檢組織的子宮頸上皮細(xì)胞電子顯微鏡照片上，測出一定范圍內(nèi)的細(xì)胞膜長度為8128像素，橋粒長度為1229像素，計算出橋粒長度占細(xì)胞膜總長度的15％，用此方法觀察到癌細(xì)胞的橋粒值遠(yuǎn)小于正常細(xì)胞，因此，則可以提出癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的原因之一可能與癌細(xì)胞之間的細(xì)胞連接減少有關(guān)。

（五）面積
在光鏡或電鏡免疫組織化學(xué)標(biāo)本觀察中，均涉及標(biāo)本中某些結(jié)構(gòu)面積變化的問題。圖像分析儀在一定放大倍數(shù)下，可以測出每平方微米含多少像素，方法是畫出待測結(jié)構(gòu)輪廓，在此輪廓范圍內(nèi)含多少像素可立即顯示出來，這樣即可很快算出面積的數(shù)值。例如在鐵蛋白法、膠體金法免疫電鏡技術(shù)中，可用上述方法進(jìn)行單位面積中反應(yīng)產(chǎn)物顆粒的計數(shù)，由此進(jìn)行各種實(shí)驗(yàn)條件下的比較。