對于每次測定，包括測定標樣和樣品，儀器均按以下順序自動進行工作：

1． 樣品盤轉動，定位到要測定的樣品位置；

2． 關閉蠕動泵；

3． 取樣針下移到吸氣泡位置；

4． 開蠕動泵一定時間吸取前隔離氣泡；

5． 取樣針下移扎破樣品離心管蓋壁，到吸樣位；

6． 開蠕動泵一定時間吸取待測樣品；

7． 取樣針上移到最高使之離開樣品離心管后再下移到吸氣泡位置；

8． 開蠕動泵一定時間吸取后隔離氣泡；

9． 取樣針上移到最高位；

10． 開蠕動泵一定時間，把吸取的樣品送到固定化酶傳感器前面，停泵4秒；

11． 蠕動泵低速度流注，開始測定；

12． 等待測到酶反應最大速率；

13． 蠕動泵高速清洗，直到電極電流回復較低水平，進入下一次測定。

儀器每次運行都獲得一個酶反應產生H₂O₂的電極電流數據，控制CPU根據測定標樣時的電流數據自動對儀器進行標定，再通過標定數據和測定樣品時的電極電流，經計算得到樣品中待測物的含量。如對儀器進行線性校正，則控制CPU會根據儀器的二個校正數據，獲得酶促反應的米氏動力學曲線，并由此對測線結果進行校正處理。