具體操作方法如下：
1、 測定前的準備:包括開機預熱、按差值標定方式標定IRGA、將測定用的儀器設備連接成一個開放系統。取葉片，測定葉面積后將其放入葉室，調節控制葉室至葉片的光合作用適溫度。
2、 葉片照光及測定操作:
1. 改變光源和葉片之間的距離，使到達葉片表面的光強為200μmol·m·s左右。待IRGA表頭上的指針穩定在一個位置后讀取經過葉片前后空氣CO2濃度變化的差值，按開放式系統Pn的計算公式計算光合速率。
2. 在光源和葉片之間放置一至數層白紗布，使到達葉片表面的強度每次減少50μmol·m·s，并在每一光強度下停留2~3min后讀取空氣CO2濃度變化的差值，計算光合速率，直到光強為零，光合速率為負值時止。
3、 繪制葉片光合作用對光的響應曲線:將測定的每組數據以光強為橫軸，光合速率為縱軸，將每一光強下光合速率值畫到坐標紙上的相應位置。再將大于0的光合速率值各坐標點用直線連接起來，該直線的斜率便是葉片的表觀光合量子效率值。該直線與橫軸的交點為光補償點，與縱軸的交點則為暗呼吸速率(圖2-10)。
由于實驗過程中一些難免誤差，所測各點未必都在一條直線上，因此畫線時會帶有一些人為因素，造成表觀光合量子效率值或高或低的誤差。為了避免這一誤差，好是用計算器或計算機對這些光強-光合速率資料作直線回歸，得到如下一直線回歸方程:
Pn=-R+Φ(PFD)
這里，Pn為光合速率，R為暗呼吸速率，Φ為表觀光合量子效率，PFD為到達葉片的光量子通量密度，簡稱光強。
操作時的注意事項
1. 為減小實驗誤差，用于直線回歸的資料點應多一些，以7~8個為宜。在作直線回歸時，不要使用那些光合速率為負值的資料點。由于Kok效應的影響，那些點往往明顯偏離直線，使得到的Φ值偏高或偏低。
2. 本節介紹的是針對用和離體葉片進行的測定而言的。目前先進的CIRAS-3光合作用測定系統具有控制溫度、光強度等功能，可以方便地進行該指標的測定。
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