表面增強拉曼散射光譜儀可以使用SERS活性襯底,作為具有電介質層和金屬層的各種組合的晶片（SERS襯底）.
表面增強拉曼散射光譜儀的SERS活性襯底芯片可以以不同的形式使用：作為具有電介質層和金屬層的各種組合的晶片（SERS襯底）；膠體納米粒子、二聚化納米粒子或核/殼納米粒子。所有SERS活性基底的活性層由貴金屬（主要是銀）的納米結構表示。用SERS報告子標記的銀納米球并與選擇的與可識別抗原匹配的抗體共價結合，已在SERS免疫測定中得到廣泛應用。在形成免疫復合物并洗去未結合的成分后，通過SERS分析儀進行檢測。

表面增強拉曼散射光譜儀可以用于細胞、組織、DNA, SERS基質的研究,也可用于日常化學分析和基礎科學研究。比如：
生物科學與藥物研究
利用光譜標記技術進行產品認證
違禁物質檢測
用作用于吸附的生物傳感器；
用于用配體、抗體等進行處理（需要進一步的受體沉積）